Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAP4

LMO3, LIM domain only protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3Q8TAP4 AL354740.1-201ENST00000586726 2681 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 OR13D1-201ENST00000318763 1107 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 ING3-202ENST00000339121 1222 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 RN7SKP246-201ENST00000364553 317 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 ATP5G1P8-201ENST00000416294 294 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 HNRNPA1P70-201ENST00000420836 1087 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 LINC02028-201ENST00000420947 528 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 HSD52-201ENST00000425914 1111 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 AC141930.1-201ENST00000438247 786 ntTSL 4 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 AC026477.1-201ENST00000439391 616 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 AL121929.1-201ENST00000457120 524 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 PSMB3P2-201ENST00000457237 618 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 HSFX4-201ENST00000457775 1184 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 RN7SL50P-201ENST00000461146 298 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 ENO1P3-201ENST00000484903 1224 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 AC008897.2-201ENST00000501886 527 ntTSL 4 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 NUP210P3-201ENST00000506964 388 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 LRRC37A13P-201ENST00000546055 287 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 ADSSL1-210ENST00000556623 652 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 BCO1-203ENST00000564552 949 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 AC087564.1-201ENST00000569751 456 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 MIR4419A-201ENST00000583845 77 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 AC010615.2-206ENST00000593653 556 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 LINC00649-212ENST00000601471 538 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 AL591926.7-201ENST00000614301 211 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 AC016991.1-201ENST00000621514 385 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 AC100757.2-201ENST00000622316 280 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 ASNSD1-201ENST00000260952 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 AL392183.1-201ENST00000606622 2436 ntTSL 4 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 CLUL1-203ENST00000540035 2199 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 KDM4D-203ENST00000610872 2191 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 PPP2R1B-201ENST00000311129 2082 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 CEP63-201ENST00000332047 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 ITIH6-201ENST00000218436 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 NOL11-201ENST00000253247 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 NCOA4P4-201ENST00000513338 1861 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 ZNF780A-201ENST00000340963 3674 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 NIPAL3-201ENST00000003912 5481 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 NEK6-215ENST00000546191 2580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 DIAPH3-203ENST00000400319 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 ATP6AP1L-201ENST00000380167 2503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 RAF1P1-201ENST00000508566 1696 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 PIK3R1-202ENST00000336483 2439 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 LINC00426-207ENST00000447147 1589 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 GALNTL6-203ENST00000506823 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 SPTB-208ENST00000556626 10153 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 FZD6-201ENST00000358755 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 GHR-212ENST00000620156 4529 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 BTN3A2-204ENST00000396948 1494 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 SMC1B-202ENST00000404354 3636 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 DDX46-202ENST00000452510 5689 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 SZRD1-202ENST00000401089 3447 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 AL096869.3-201ENST00000567837 2626 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 AC024600.1-201ENST00000425902 2572 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 Z95114.3-201ENST00000624395 1921 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 JAKMIP2-AS1-201ENST00000626945 1920 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 RN7SKP87-201ENST00000364096 301 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 RAB18-202ENST00000375802 617 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 HIST1H2BI-201ENST00000377733 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 NIFKP1-201ENST00000398317 889 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 OSTCP6-201ENST00000407493 457 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 TAC3-205ENST00000415231 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 FAM180A-202ENST00000415751 1073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 SLC25A5P4-201ENST00000418448 869 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 AL139246.3-201ENST00000424215 626 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 AC121158.1-201ENST00000425645 239 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 EMC3-202ENST00000429759 751 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 AL591074.1-201ENST00000437012 797 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 DNM1P24-201ENST00000441091 490 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 AL157392.2-201ENST00000449462 474 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 AC010982.1-201ENST00000450325 465 ntTSL 4 BASIC10.18□□□□□ -0.78
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LMO3Q8TAP4 RN7SL632P-201ENST00000489734 266 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 AC114744.1-201ENST00000498116 666 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 AC105416.1-201ENST00000506991 842 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 RACK1-225ENST00000511566 825 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
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LMO3Q8TAP4 TUBB4BP1-201ENST00000545422 178 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
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LMO3Q8TAP4 AC005972.1-201ENST00000581596 912 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 AC009831.3-201ENST00000582538 586 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 MIR7515HG-229ENST00000589150 962 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 RPS16-204ENST00000599539 555 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 AC121493.1-201ENST00000602316 450 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 CUTA-214ENST00000607266 661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 AC023302.1-201ENST00000607458 492 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 AC068888.1-205ENST00000607643 662 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 AC113349.2-201ENST00000607804 377 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 AC073255.1-201ENST00000624149 177 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 RABGEF1-201ENST00000284957 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 UTP4-202ENST00000352319 1841 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 SCO1-201ENST00000255390 9612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 PUM1-201ENST00000257075 5360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 MAPK10-375ENST00000641989 2331 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 SLC25A25-AS1-201ENST00000418747 6391 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 ZNF429-201ENST00000358491 2233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 PAK6-201ENST00000260404 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 SRGAP2-217ENST00000624873 4705 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 TNRC6C-202ENST00000335749 9740 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
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