Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R9

CCDC61, Coiled-coil domain-containing protein 61, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC61Q9Y6R9 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC61Q9Y6R9 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC61Q9Y6R9 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC61Q9Y6R9 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC61Q9Y6R9 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC61Q9Y6R9 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC61Q9Y6R9 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC61Q9Y6R9 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC61Q9Y6R9 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC61Q9Y6R9 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC61Q9Y6R9 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC61Q9Y6R9 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC61Q9Y6R9 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC61Q9Y6R9 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC61Q9Y6R9 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC61Q9Y6R9 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC61Q9Y6R9 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC61Q9Y6R9 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC61Q9Y6R9 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CCDC61Q9Y6R9 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
CCDC61Q9Y6R9 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CCDC61Q9Y6R9 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
CCDC61Q9Y6R9 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CCDC61Q9Y6R9 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
CCDC61Q9Y6R9 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CCDC61Q9Y6R9 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CCDC61Q9Y6R9 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CCDC61Q9Y6R9 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CCDC61Q9Y6R9 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
CCDC61Q9Y6R9 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CCDC61Q9Y6R9 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CCDC61Q9Y6R9 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CCDC61Q9Y6R9 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
CCDC61Q9Y6R9 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CCDC61Q9Y6R9 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC61Q9Y6R9 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC61Q9Y6R9 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC61Q9Y6R9 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC61Q9Y6R9 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC61Q9Y6R9 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC61Q9Y6R9 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC61Q9Y6R9 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC61Q9Y6R9 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC61Q9Y6R9 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC61Q9Y6R9 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC61Q9Y6R9 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC61Q9Y6R9 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC61Q9Y6R9 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC61Q9Y6R9 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC61Q9Y6R9 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC61Q9Y6R9 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC61Q9Y6R9 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC61Q9Y6R9 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC61Q9Y6R9 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC61Q9Y6R9 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC61Q9Y6R9 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC61Q9Y6R9 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC61Q9Y6R9 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC61Q9Y6R9 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC61Q9Y6R9 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC61Q9Y6R9 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC61Q9Y6R9 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC61Q9Y6R9 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC61Q9Y6R9 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC61Q9Y6R9 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC61Q9Y6R9 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC61Q9Y6R9 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC61Q9Y6R9 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC61Q9Y6R9 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC61Q9Y6R9 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC61Q9Y6R9 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC61Q9Y6R9 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC61Q9Y6R9 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC61Q9Y6R9 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC61Q9Y6R9 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC61Q9Y6R9 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC61Q9Y6R9 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC61Q9Y6R9 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC61Q9Y6R9 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC61Q9Y6R9 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC61Q9Y6R9 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC61Q9Y6R9 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC61Q9Y6R9 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC61Q9Y6R9 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC61Q9Y6R9 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC61Q9Y6R9 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC61Q9Y6R9 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC61Q9Y6R9 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC61Q9Y6R9 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC61Q9Y6R9 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC61Q9Y6R9 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC61Q9Y6R9 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC61Q9Y6R9 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC61Q9Y6R9 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CCDC61Q9Y6R9 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CCDC61Q9Y6R9 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CCDC61Q9Y6R9 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CCDC61Q9Y6R9 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CCDC61Q9Y6R9 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CCDC61Q9Y6R9 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms