Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6J3

SMAD5-AS1, SMAD5 antisense gene protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD5-AS1Q9Y6J3 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAD5-AS1Q9Y6J3 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAD5-AS1Q9Y6J3 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAD5-AS1Q9Y6J3 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAD5-AS1Q9Y6J3 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAD5-AS1Q9Y6J3 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD5-AS1Q9Y6J3 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD5-AS1Q9Y6J3 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD5-AS1Q9Y6J3 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD5-AS1Q9Y6J3 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD5-AS1Q9Y6J3 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD5-AS1Q9Y6J3 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD5-AS1Q9Y6J3 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD5-AS1Q9Y6J3 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD5-AS1Q9Y6J3 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD5-AS1Q9Y6J3 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD5-AS1Q9Y6J3 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAD5-AS1Q9Y6J3 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAD5-AS1Q9Y6J3 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAD5-AS1Q9Y6J3 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAD5-AS1Q9Y6J3 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAD5-AS1Q9Y6J3 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAD5-AS1Q9Y6J3 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMAD5-AS1Q9Y6J3 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMAD5-AS1Q9Y6J3 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SMAD5-AS1Q9Y6J3 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMAD5-AS1Q9Y6J3 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMAD5-AS1Q9Y6J3 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms