Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6F8

CDY1, Testis-specific chromodomain protein Y 1, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDY1Q9Y6F8 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDY1Q9Y6F8 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDY1Q9Y6F8 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDY1Q9Y6F8 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDY1Q9Y6F8 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDY1Q9Y6F8 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDY1Q9Y6F8 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDY1Q9Y6F8 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDY1Q9Y6F8 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CDY1Q9Y6F8 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CDY1Q9Y6F8 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CDY1Q9Y6F8 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDY1Q9Y6F8 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDY1Q9Y6F8 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDY1Q9Y6F8 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDY1Q9Y6F8 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDY1Q9Y6F8 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDY1Q9Y6F8 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDY1Q9Y6F8 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDY1Q9Y6F8 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDY1Q9Y6F8 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDY1Q9Y6F8 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDY1Q9Y6F8 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDY1Q9Y6F8 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDY1Q9Y6F8 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDY1Q9Y6F8 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDY1Q9Y6F8 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDY1Q9Y6F8 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDY1Q9Y6F8 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDY1Q9Y6F8 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDY1Q9Y6F8 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDY1Q9Y6F8 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDY1Q9Y6F8 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDY1Q9Y6F8 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDY1Q9Y6F8 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDY1Q9Y6F8 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDY1Q9Y6F8 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDY1Q9Y6F8 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDY1Q9Y6F8 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDY1Q9Y6F8 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDY1Q9Y6F8 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDY1Q9Y6F8 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDY1Q9Y6F8 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDY1Q9Y6F8 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDY1Q9Y6F8 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDY1Q9Y6F8 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDY1Q9Y6F8 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDY1Q9Y6F8 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDY1Q9Y6F8 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDY1Q9Y6F8 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDY1Q9Y6F8 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDY1Q9Y6F8 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CDY1Q9Y6F8 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDY1Q9Y6F8 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CDY1Q9Y6F8 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDY1Q9Y6F8 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDY1Q9Y6F8 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDY1Q9Y6F8 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDY1Q9Y6F8 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDY1Q9Y6F8 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDY1Q9Y6F8 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDY1Q9Y6F8 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDY1Q9Y6F8 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CDY1Q9Y6F8 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CDY1Q9Y6F8 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CDY1Q9Y6F8 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
CDY1Q9Y6F8 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDY1Q9Y6F8 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDY1Q9Y6F8 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDY1Q9Y6F8 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDY1Q9Y6F8 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDY1Q9Y6F8 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDY1Q9Y6F8 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDY1Q9Y6F8 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CDY1Q9Y6F8 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDY1Q9Y6F8 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDY1Q9Y6F8 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDY1Q9Y6F8 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDY1Q9Y6F8 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDY1Q9Y6F8 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDY1Q9Y6F8 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDY1Q9Y6F8 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDY1Q9Y6F8 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDY1Q9Y6F8 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDY1Q9Y6F8 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDY1Q9Y6F8 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDY1Q9Y6F8 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDY1Q9Y6F8 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDY1Q9Y6F8 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CDY1Q9Y6F8 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDY1Q9Y6F8 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CDY1Q9Y6F8 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDY1Q9Y6F8 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDY1Q9Y6F8 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CDY1Q9Y6F8 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CDY1Q9Y6F8 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CDY1Q9Y6F8 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CDY1Q9Y6F8 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CDY1Q9Y6F8 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CDY1Q9Y6F8 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms