Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5U2

TSSC4, Protein TSSC4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSC4Q9Y5U2 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TSSC4Q9Y5U2 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TSSC4Q9Y5U2 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TSSC4Q9Y5U2 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TSSC4Q9Y5U2 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TSSC4Q9Y5U2 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TSSC4Q9Y5U2 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TSSC4Q9Y5U2 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TSSC4Q9Y5U2 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TSSC4Q9Y5U2 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TSSC4Q9Y5U2 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TSSC4Q9Y5U2 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TSSC4Q9Y5U2 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TSSC4Q9Y5U2 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TSSC4Q9Y5U2 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TSSC4Q9Y5U2 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TSSC4Q9Y5U2 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TSSC4Q9Y5U2 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TSSC4Q9Y5U2 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TSSC4Q9Y5U2 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TSSC4Q9Y5U2 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TSSC4Q9Y5U2 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TSSC4Q9Y5U2 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TSSC4Q9Y5U2 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TSSC4Q9Y5U2 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TSSC4Q9Y5U2 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TSSC4Q9Y5U2 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TSSC4Q9Y5U2 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TSSC4Q9Y5U2 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TSSC4Q9Y5U2 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TSSC4Q9Y5U2 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TSSC4Q9Y5U2 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TSSC4Q9Y5U2 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TSSC4Q9Y5U2 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TSSC4Q9Y5U2 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TSSC4Q9Y5U2 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TSSC4Q9Y5U2 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TSSC4Q9Y5U2 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TSSC4Q9Y5U2 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TSSC4Q9Y5U2 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TSSC4Q9Y5U2 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TSSC4Q9Y5U2 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TSSC4Q9Y5U2 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TSSC4Q9Y5U2 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TSSC4Q9Y5U2 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TSSC4Q9Y5U2 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TSSC4Q9Y5U2 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TSSC4Q9Y5U2 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TSSC4Q9Y5U2 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TSSC4Q9Y5U2 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TSSC4Q9Y5U2 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TSSC4Q9Y5U2 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TSSC4Q9Y5U2 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TSSC4Q9Y5U2 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TSSC4Q9Y5U2 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TSSC4Q9Y5U2 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TSSC4Q9Y5U2 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TSSC4Q9Y5U2 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TSSC4Q9Y5U2 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TSSC4Q9Y5U2 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TSSC4Q9Y5U2 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TSSC4Q9Y5U2 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TSSC4Q9Y5U2 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TSSC4Q9Y5U2 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TSSC4Q9Y5U2 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TSSC4Q9Y5U2 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TSSC4Q9Y5U2 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TSSC4Q9Y5U2 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TSSC4Q9Y5U2 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TSSC4Q9Y5U2 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TSSC4Q9Y5U2 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TSSC4Q9Y5U2 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TSSC4Q9Y5U2 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TSSC4Q9Y5U2 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TSSC4Q9Y5U2 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TSSC4Q9Y5U2 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TSSC4Q9Y5U2 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TSSC4Q9Y5U2 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TSSC4Q9Y5U2 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TSSC4Q9Y5U2 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TSSC4Q9Y5U2 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TSSC4Q9Y5U2 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TSSC4Q9Y5U2 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TSSC4Q9Y5U2 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TSSC4Q9Y5U2 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TSSC4Q9Y5U2 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TSSC4Q9Y5U2 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TSSC4Q9Y5U2 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TSSC4Q9Y5U2 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TSSC4Q9Y5U2 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TSSC4Q9Y5U2 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TSSC4Q9Y5U2 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TSSC4Q9Y5U2 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TSSC4Q9Y5U2 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TSSC4Q9Y5U2 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TSSC4Q9Y5U2 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TSSC4Q9Y5U2 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TSSC4Q9Y5U2 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TSSC4Q9Y5U2 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TSSC4Q9Y5U2 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms