Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5J5

PHLDA3, Pleckstrin homology-like domain family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHLDA3Q9Y5J5 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PHLDA3Q9Y5J5 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PHLDA3Q9Y5J5 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PHLDA3Q9Y5J5 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PHLDA3Q9Y5J5 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PHLDA3Q9Y5J5 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PHLDA3Q9Y5J5 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PHLDA3Q9Y5J5 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PHLDA3Q9Y5J5 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PHLDA3Q9Y5J5 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PHLDA3Q9Y5J5 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PHLDA3Q9Y5J5 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PHLDA3Q9Y5J5 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PHLDA3Q9Y5J5 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PHLDA3Q9Y5J5 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PHLDA3Q9Y5J5 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PHLDA3Q9Y5J5 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PHLDA3Q9Y5J5 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PHLDA3Q9Y5J5 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PHLDA3Q9Y5J5 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PHLDA3Q9Y5J5 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PHLDA3Q9Y5J5 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PHLDA3Q9Y5J5 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PHLDA3Q9Y5J5 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PHLDA3Q9Y5J5 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PHLDA3Q9Y5J5 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PHLDA3Q9Y5J5 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PHLDA3Q9Y5J5 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PHLDA3Q9Y5J5 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PHLDA3Q9Y5J5 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PHLDA3Q9Y5J5 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PHLDA3Q9Y5J5 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PHLDA3Q9Y5J5 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PHLDA3Q9Y5J5 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PHLDA3Q9Y5J5 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PHLDA3Q9Y5J5 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PHLDA3Q9Y5J5 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PHLDA3Q9Y5J5 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PHLDA3Q9Y5J5 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PHLDA3Q9Y5J5 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PHLDA3Q9Y5J5 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PHLDA3Q9Y5J5 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PHLDA3Q9Y5J5 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PHLDA3Q9Y5J5 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PHLDA3Q9Y5J5 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PHLDA3Q9Y5J5 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PHLDA3Q9Y5J5 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PHLDA3Q9Y5J5 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PHLDA3Q9Y5J5 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PHLDA3Q9Y5J5 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PHLDA3Q9Y5J5 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PHLDA3Q9Y5J5 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PHLDA3Q9Y5J5 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PHLDA3Q9Y5J5 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PHLDA3Q9Y5J5 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PHLDA3Q9Y5J5 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PHLDA3Q9Y5J5 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PHLDA3Q9Y5J5 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PHLDA3Q9Y5J5 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PHLDA3Q9Y5J5 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PHLDA3Q9Y5J5 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PHLDA3Q9Y5J5 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PHLDA3Q9Y5J5 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PHLDA3Q9Y5J5 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PHLDA3Q9Y5J5 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PHLDA3Q9Y5J5 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PHLDA3Q9Y5J5 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PHLDA3Q9Y5J5 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PHLDA3Q9Y5J5 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PHLDA3Q9Y5J5 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PHLDA3Q9Y5J5 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PHLDA3Q9Y5J5 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PHLDA3Q9Y5J5 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PHLDA3Q9Y5J5 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PHLDA3Q9Y5J5 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PHLDA3Q9Y5J5 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PHLDA3Q9Y5J5 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PHLDA3Q9Y5J5 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PHLDA3Q9Y5J5 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PHLDA3Q9Y5J5 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PHLDA3Q9Y5J5 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PHLDA3Q9Y5J5 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PHLDA3Q9Y5J5 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PHLDA3Q9Y5J5 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PHLDA3Q9Y5J5 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PHLDA3Q9Y5J5 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PHLDA3Q9Y5J5 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PHLDA3Q9Y5J5 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PHLDA3Q9Y5J5 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PHLDA3Q9Y5J5 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PHLDA3Q9Y5J5 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PHLDA3Q9Y5J5 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PHLDA3Q9Y5J5 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PHLDA3Q9Y5J5 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PHLDA3Q9Y5J5 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PHLDA3Q9Y5J5 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PHLDA3Q9Y5J5 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PHLDA3Q9Y5J5 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PHLDA3Q9Y5J5 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PHLDA3Q9Y5J5 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms