Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5F0

PCDHB13, Protocadherin beta-13, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB13Q9Y5F0 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDHB13Q9Y5F0 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDHB13Q9Y5F0 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDHB13Q9Y5F0 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDHB13Q9Y5F0 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDHB13Q9Y5F0 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDHB13Q9Y5F0 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDHB13Q9Y5F0 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDHB13Q9Y5F0 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDHB13Q9Y5F0 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDHB13Q9Y5F0 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDHB13Q9Y5F0 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDHB13Q9Y5F0 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDHB13Q9Y5F0 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHB13Q9Y5F0 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHB13Q9Y5F0 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHB13Q9Y5F0 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHB13Q9Y5F0 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHB13Q9Y5F0 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHB13Q9Y5F0 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHB13Q9Y5F0 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHB13Q9Y5F0 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHB13Q9Y5F0 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHB13Q9Y5F0 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHB13Q9Y5F0 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHB13Q9Y5F0 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHB13Q9Y5F0 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHB13Q9Y5F0 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHB13Q9Y5F0 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHB13Q9Y5F0 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHB13Q9Y5F0 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHB13Q9Y5F0 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHB13Q9Y5F0 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHB13Q9Y5F0 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHB13Q9Y5F0 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHB13Q9Y5F0 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHB13Q9Y5F0 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHB13Q9Y5F0 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHB13Q9Y5F0 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHB13Q9Y5F0 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHB13Q9Y5F0 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHB13Q9Y5F0 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHB13Q9Y5F0 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHB13Q9Y5F0 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHB13Q9Y5F0 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHB13Q9Y5F0 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHB13Q9Y5F0 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHB13Q9Y5F0 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHB13Q9Y5F0 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHB13Q9Y5F0 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHB13Q9Y5F0 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHB13Q9Y5F0 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHB13Q9Y5F0 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHB13Q9Y5F0 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHB13Q9Y5F0 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHB13Q9Y5F0 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHB13Q9Y5F0 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHB13Q9Y5F0 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHB13Q9Y5F0 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHB13Q9Y5F0 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHB13Q9Y5F0 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHB13Q9Y5F0 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHB13Q9Y5F0 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHB13Q9Y5F0 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHB13Q9Y5F0 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHB13Q9Y5F0 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
PCDHB13Q9Y5F0 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
PCDHB13Q9Y5F0 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
PCDHB13Q9Y5F0 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
PCDHB13Q9Y5F0 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHB13Q9Y5F0 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHB13Q9Y5F0 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHB13Q9Y5F0 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHB13Q9Y5F0 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHB13Q9Y5F0 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHB13Q9Y5F0 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHB13Q9Y5F0 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHB13Q9Y5F0 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHB13Q9Y5F0 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHB13Q9Y5F0 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHB13Q9Y5F0 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHB13Q9Y5F0 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHB13Q9Y5F0 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHB13Q9Y5F0 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHB13Q9Y5F0 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHB13Q9Y5F0 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHB13Q9Y5F0 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHB13Q9Y5F0 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHB13Q9Y5F0 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHB13Q9Y5F0 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHB13Q9Y5F0 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHB13Q9Y5F0 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHB13Q9Y5F0 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHB13Q9Y5F0 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHB13Q9Y5F0 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHB13Q9Y5F0 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHB13Q9Y5F0 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHB13Q9Y5F0 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHB13Q9Y5F0 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHB13Q9Y5F0 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms