Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y561

LRP12, Low-density lipoprotein receptor-related protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP12Q9Y561 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LRP12Q9Y561 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LRP12Q9Y561 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LRP12Q9Y561 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LRP12Q9Y561 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LRP12Q9Y561 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LRP12Q9Y561 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LRP12Q9Y561 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LRP12Q9Y561 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LRP12Q9Y561 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
LRP12Q9Y561 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LRP12Q9Y561 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LRP12Q9Y561 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LRP12Q9Y561 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LRP12Q9Y561 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LRP12Q9Y561 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LRP12Q9Y561 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LRP12Q9Y561 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LRP12Q9Y561 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LRP12Q9Y561 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.5
LRP12Q9Y561 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
LRP12Q9Y561 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LRP12Q9Y561 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LRP12Q9Y561 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LRP12Q9Y561 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LRP12Q9Y561 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LRP12Q9Y561 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LRP12Q9Y561 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LRP12Q9Y561 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LRP12Q9Y561 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LRP12Q9Y561 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LRP12Q9Y561 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
LRP12Q9Y561 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LRP12Q9Y561 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LRP12Q9Y561 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LRP12Q9Y561 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LRP12Q9Y561 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LRP12Q9Y561 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LRP12Q9Y561 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LRP12Q9Y561 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LRP12Q9Y561 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LRP12Q9Y561 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LRP12Q9Y561 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LRP12Q9Y561 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LRP12Q9Y561 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LRP12Q9Y561 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LRP12Q9Y561 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LRP12Q9Y561 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LRP12Q9Y561 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LRP12Q9Y561 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LRP12Q9Y561 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LRP12Q9Y561 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LRP12Q9Y561 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LRP12Q9Y561 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LRP12Q9Y561 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LRP12Q9Y561 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LRP12Q9Y561 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LRP12Q9Y561 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LRP12Q9Y561 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LRP12Q9Y561 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LRP12Q9Y561 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LRP12Q9Y561 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LRP12Q9Y561 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LRP12Q9Y561 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LRP12Q9Y561 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LRP12Q9Y561 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LRP12Q9Y561 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LRP12Q9Y561 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LRP12Q9Y561 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LRP12Q9Y561 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LRP12Q9Y561 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LRP12Q9Y561 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LRP12Q9Y561 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LRP12Q9Y561 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LRP12Q9Y561 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LRP12Q9Y561 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LRP12Q9Y561 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LRP12Q9Y561 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LRP12Q9Y561 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LRP12Q9Y561 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LRP12Q9Y561 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LRP12Q9Y561 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LRP12Q9Y561 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LRP12Q9Y561 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LRP12Q9Y561 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
LRP12Q9Y561 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LRP12Q9Y561 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LRP12Q9Y561 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LRP12Q9Y561 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LRP12Q9Y561 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LRP12Q9Y561 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LRP12Q9Y561 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LRP12Q9Y561 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LRP12Q9Y561 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LRP12Q9Y561 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LRP12Q9Y561 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LRP12Q9Y561 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LRP12Q9Y561 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LRP12Q9Y561 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LRP12Q9Y561 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms