Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4F1

FARP1, FERM, RhoGEF and pleckstrin domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,045 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FARP1Q9Y4F1 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
FARP1Q9Y4F1 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FARP1Q9Y4F1 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FARP1Q9Y4F1 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
FARP1Q9Y4F1 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FARP1Q9Y4F1 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FARP1Q9Y4F1 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FARP1Q9Y4F1 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FARP1Q9Y4F1 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FARP1Q9Y4F1 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FARP1Q9Y4F1 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FARP1Q9Y4F1 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FARP1Q9Y4F1 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FARP1Q9Y4F1 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FARP1Q9Y4F1 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FARP1Q9Y4F1 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FARP1Q9Y4F1 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FARP1Q9Y4F1 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FARP1Q9Y4F1 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FARP1Q9Y4F1 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FARP1Q9Y4F1 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FARP1Q9Y4F1 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FARP1Q9Y4F1 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FARP1Q9Y4F1 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FARP1Q9Y4F1 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FARP1Q9Y4F1 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FARP1Q9Y4F1 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FARP1Q9Y4F1 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FARP1Q9Y4F1 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FARP1Q9Y4F1 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FARP1Q9Y4F1 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FARP1Q9Y4F1 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FARP1Q9Y4F1 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FARP1Q9Y4F1 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FARP1Q9Y4F1 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
FARP1Q9Y4F1 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
FARP1Q9Y4F1 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FARP1Q9Y4F1 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FARP1Q9Y4F1 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FARP1Q9Y4F1 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FARP1Q9Y4F1 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FARP1Q9Y4F1 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FARP1Q9Y4F1 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FARP1Q9Y4F1 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FARP1Q9Y4F1 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FARP1Q9Y4F1 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FARP1Q9Y4F1 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FARP1Q9Y4F1 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FARP1Q9Y4F1 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FARP1Q9Y4F1 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FARP1Q9Y4F1 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FARP1Q9Y4F1 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FARP1Q9Y4F1 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FARP1Q9Y4F1 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FARP1Q9Y4F1 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FARP1Q9Y4F1 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FARP1Q9Y4F1 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FARP1Q9Y4F1 AC090142.2-201ENST00000483263 416 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
FARP1Q9Y4F1 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FARP1Q9Y4F1 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FARP1Q9Y4F1 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FARP1Q9Y4F1 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FARP1Q9Y4F1 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FARP1Q9Y4F1 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FARP1Q9Y4F1 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FARP1Q9Y4F1 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
FARP1Q9Y4F1 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FARP1Q9Y4F1 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FARP1Q9Y4F1 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FARP1Q9Y4F1 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FARP1Q9Y4F1 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FARP1Q9Y4F1 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FARP1Q9Y4F1 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FARP1Q9Y4F1 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FARP1Q9Y4F1 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FARP1Q9Y4F1 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
FARP1Q9Y4F1 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FARP1Q9Y4F1 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FARP1Q9Y4F1 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FARP1Q9Y4F1 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FARP1Q9Y4F1 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FARP1Q9Y4F1 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FARP1Q9Y4F1 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FARP1Q9Y4F1 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FARP1Q9Y4F1 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FARP1Q9Y4F1 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FARP1Q9Y4F1 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FARP1Q9Y4F1 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FARP1Q9Y4F1 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
FARP1Q9Y4F1 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FARP1Q9Y4F1 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FARP1Q9Y4F1 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FARP1Q9Y4F1 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FARP1Q9Y4F1 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
FARP1Q9Y4F1 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
FARP1Q9Y4F1 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FARP1Q9Y4F1 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FARP1Q9Y4F1 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FARP1Q9Y4F1 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FARP1Q9Y4F1 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
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