Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3T6

R3HCC1, R3H and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HCC1Q9Y3T6 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
R3HCC1Q9Y3T6 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
R3HCC1Q9Y3T6 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
R3HCC1Q9Y3T6 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
R3HCC1Q9Y3T6 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
R3HCC1Q9Y3T6 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
R3HCC1Q9Y3T6 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
R3HCC1Q9Y3T6 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
R3HCC1Q9Y3T6 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
R3HCC1Q9Y3T6 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
R3HCC1Q9Y3T6 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
R3HCC1Q9Y3T6 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
R3HCC1Q9Y3T6 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
R3HCC1Q9Y3T6 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
R3HCC1Q9Y3T6 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
R3HCC1Q9Y3T6 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
R3HCC1Q9Y3T6 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
R3HCC1Q9Y3T6 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
R3HCC1Q9Y3T6 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
R3HCC1Q9Y3T6 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
R3HCC1Q9Y3T6 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
R3HCC1Q9Y3T6 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
R3HCC1Q9Y3T6 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
R3HCC1Q9Y3T6 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
R3HCC1Q9Y3T6 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
R3HCC1Q9Y3T6 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
R3HCC1Q9Y3T6 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
R3HCC1Q9Y3T6 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
R3HCC1Q9Y3T6 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
R3HCC1Q9Y3T6 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
R3HCC1Q9Y3T6 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
R3HCC1Q9Y3T6 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
R3HCC1Q9Y3T6 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
R3HCC1Q9Y3T6 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
R3HCC1Q9Y3T6 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
R3HCC1Q9Y3T6 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
R3HCC1Q9Y3T6 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
R3HCC1Q9Y3T6 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
R3HCC1Q9Y3T6 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
R3HCC1Q9Y3T6 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
R3HCC1Q9Y3T6 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
R3HCC1Q9Y3T6 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
R3HCC1Q9Y3T6 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
R3HCC1Q9Y3T6 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
R3HCC1Q9Y3T6 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
R3HCC1Q9Y3T6 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
R3HCC1Q9Y3T6 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
R3HCC1Q9Y3T6 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
R3HCC1Q9Y3T6 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
R3HCC1Q9Y3T6 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
R3HCC1Q9Y3T6 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
R3HCC1Q9Y3T6 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
R3HCC1Q9Y3T6 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
R3HCC1Q9Y3T6 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
R3HCC1Q9Y3T6 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
R3HCC1Q9Y3T6 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
R3HCC1Q9Y3T6 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
R3HCC1Q9Y3T6 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
R3HCC1Q9Y3T6 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
R3HCC1Q9Y3T6 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
R3HCC1Q9Y3T6 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
R3HCC1Q9Y3T6 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
R3HCC1Q9Y3T6 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
R3HCC1Q9Y3T6 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
R3HCC1Q9Y3T6 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
R3HCC1Q9Y3T6 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
R3HCC1Q9Y3T6 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
R3HCC1Q9Y3T6 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
R3HCC1Q9Y3T6 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
R3HCC1Q9Y3T6 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
R3HCC1Q9Y3T6 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
R3HCC1Q9Y3T6 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
R3HCC1Q9Y3T6 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
R3HCC1Q9Y3T6 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
R3HCC1Q9Y3T6 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
R3HCC1Q9Y3T6 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
R3HCC1Q9Y3T6 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
R3HCC1Q9Y3T6 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
R3HCC1Q9Y3T6 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
R3HCC1Q9Y3T6 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
R3HCC1Q9Y3T6 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
R3HCC1Q9Y3T6 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
R3HCC1Q9Y3T6 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
R3HCC1Q9Y3T6 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
R3HCC1Q9Y3T6 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
R3HCC1Q9Y3T6 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
R3HCC1Q9Y3T6 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
R3HCC1Q9Y3T6 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
R3HCC1Q9Y3T6 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
R3HCC1Q9Y3T6 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
R3HCC1Q9Y3T6 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
R3HCC1Q9Y3T6 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
R3HCC1Q9Y3T6 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
R3HCC1Q9Y3T6 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
R3HCC1Q9Y3T6 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
R3HCC1Q9Y3T6 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
R3HCC1Q9Y3T6 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
R3HCC1Q9Y3T6 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
R3HCC1Q9Y3T6 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
R3HCC1Q9Y3T6 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms