Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y235

APOBEC2, C->U-editing enzyme APOBEC-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC2Q9Y235 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
APOBEC2Q9Y235 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
APOBEC2Q9Y235 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
APOBEC2Q9Y235 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
APOBEC2Q9Y235 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
APOBEC2Q9Y235 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
APOBEC2Q9Y235 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
APOBEC2Q9Y235 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
APOBEC2Q9Y235 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
APOBEC2Q9Y235 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
APOBEC2Q9Y235 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
APOBEC2Q9Y235 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
APOBEC2Q9Y235 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
APOBEC2Q9Y235 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
APOBEC2Q9Y235 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
APOBEC2Q9Y235 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
APOBEC2Q9Y235 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
APOBEC2Q9Y235 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
APOBEC2Q9Y235 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
APOBEC2Q9Y235 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
APOBEC2Q9Y235 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
APOBEC2Q9Y235 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
APOBEC2Q9Y235 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
APOBEC2Q9Y235 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
APOBEC2Q9Y235 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
APOBEC2Q9Y235 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
APOBEC2Q9Y235 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
APOBEC2Q9Y235 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
APOBEC2Q9Y235 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
APOBEC2Q9Y235 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
APOBEC2Q9Y235 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
APOBEC2Q9Y235 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
APOBEC2Q9Y235 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
APOBEC2Q9Y235 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
APOBEC2Q9Y235 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
APOBEC2Q9Y235 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
APOBEC2Q9Y235 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
APOBEC2Q9Y235 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
APOBEC2Q9Y235 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
APOBEC2Q9Y235 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
APOBEC2Q9Y235 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
APOBEC2Q9Y235 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
APOBEC2Q9Y235 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
APOBEC2Q9Y235 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
APOBEC2Q9Y235 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
APOBEC2Q9Y235 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
APOBEC2Q9Y235 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
APOBEC2Q9Y235 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
APOBEC2Q9Y235 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
APOBEC2Q9Y235 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
APOBEC2Q9Y235 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
APOBEC2Q9Y235 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
APOBEC2Q9Y235 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
APOBEC2Q9Y235 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
APOBEC2Q9Y235 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
APOBEC2Q9Y235 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
APOBEC2Q9Y235 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
APOBEC2Q9Y235 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
APOBEC2Q9Y235 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
APOBEC2Q9Y235 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
APOBEC2Q9Y235 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
APOBEC2Q9Y235 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
APOBEC2Q9Y235 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
APOBEC2Q9Y235 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
APOBEC2Q9Y235 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
APOBEC2Q9Y235 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
APOBEC2Q9Y235 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
APOBEC2Q9Y235 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
APOBEC2Q9Y235 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
APOBEC2Q9Y235 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
APOBEC2Q9Y235 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
APOBEC2Q9Y235 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
APOBEC2Q9Y235 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
APOBEC2Q9Y235 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
APOBEC2Q9Y235 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
APOBEC2Q9Y235 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
APOBEC2Q9Y235 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
APOBEC2Q9Y235 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
APOBEC2Q9Y235 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
APOBEC2Q9Y235 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
APOBEC2Q9Y235 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
APOBEC2Q9Y235 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
APOBEC2Q9Y235 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
APOBEC2Q9Y235 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
APOBEC2Q9Y235 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
APOBEC2Q9Y235 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
APOBEC2Q9Y235 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
APOBEC2Q9Y235 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
APOBEC2Q9Y235 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
APOBEC2Q9Y235 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
APOBEC2Q9Y235 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
APOBEC2Q9Y235 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
APOBEC2Q9Y235 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
APOBEC2Q9Y235 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
APOBEC2Q9Y235 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
APOBEC2Q9Y235 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
APOBEC2Q9Y235 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
APOBEC2Q9Y235 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
APOBEC2Q9Y235 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
APOBEC2Q9Y235 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms