Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQL6

HDAC5, Histone deacetylase 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC5Q9UQL6 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
HDAC5Q9UQL6 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HDAC5Q9UQL6 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HDAC5Q9UQL6 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HDAC5Q9UQL6 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HDAC5Q9UQL6 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HDAC5Q9UQL6 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HDAC5Q9UQL6 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HDAC5Q9UQL6 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HDAC5Q9UQL6 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HDAC5Q9UQL6 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HDAC5Q9UQL6 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HDAC5Q9UQL6 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HDAC5Q9UQL6 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HDAC5Q9UQL6 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HDAC5Q9UQL6 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HDAC5Q9UQL6 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HDAC5Q9UQL6 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HDAC5Q9UQL6 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HDAC5Q9UQL6 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HDAC5Q9UQL6 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HDAC5Q9UQL6 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
HDAC5Q9UQL6 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HDAC5Q9UQL6 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HDAC5Q9UQL6 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HDAC5Q9UQL6 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HDAC5Q9UQL6 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HDAC5Q9UQL6 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HDAC5Q9UQL6 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HDAC5Q9UQL6 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HDAC5Q9UQL6 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HDAC5Q9UQL6 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HDAC5Q9UQL6 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HDAC5Q9UQL6 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HDAC5Q9UQL6 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
HDAC5Q9UQL6 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HDAC5Q9UQL6 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HDAC5Q9UQL6 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HDAC5Q9UQL6 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
HDAC5Q9UQL6 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HDAC5Q9UQL6 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HDAC5Q9UQL6 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HDAC5Q9UQL6 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
HDAC5Q9UQL6 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
HDAC5Q9UQL6 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
HDAC5Q9UQL6 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HDAC5Q9UQL6 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HDAC5Q9UQL6 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HDAC5Q9UQL6 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
HDAC5Q9UQL6 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HDAC5Q9UQL6 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HDAC5Q9UQL6 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
HDAC5Q9UQL6 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HDAC5Q9UQL6 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HDAC5Q9UQL6 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HDAC5Q9UQL6 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HDAC5Q9UQL6 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HDAC5Q9UQL6 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HDAC5Q9UQL6 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HDAC5Q9UQL6 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HDAC5Q9UQL6 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HDAC5Q9UQL6 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HDAC5Q9UQL6 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HDAC5Q9UQL6 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HDAC5Q9UQL6 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HDAC5Q9UQL6 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HDAC5Q9UQL6 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HDAC5Q9UQL6 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HDAC5Q9UQL6 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HDAC5Q9UQL6 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HDAC5Q9UQL6 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HDAC5Q9UQL6 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HDAC5Q9UQL6 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
HDAC5Q9UQL6 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HDAC5Q9UQL6 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HDAC5Q9UQL6 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HDAC5Q9UQL6 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
HDAC5Q9UQL6 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
HDAC5Q9UQL6 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HDAC5Q9UQL6 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HDAC5Q9UQL6 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HDAC5Q9UQL6 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HDAC5Q9UQL6 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HDAC5Q9UQL6 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HDAC5Q9UQL6 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
HDAC5Q9UQL6 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HDAC5Q9UQL6 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
HDAC5Q9UQL6 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HDAC5Q9UQL6 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HDAC5Q9UQL6 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
HDAC5Q9UQL6 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HDAC5Q9UQL6 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HDAC5Q9UQL6 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HDAC5Q9UQL6 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HDAC5Q9UQL6 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HDAC5Q9UQL6 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HDAC5Q9UQL6 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
HDAC5Q9UQL6 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HDAC5Q9UQL6 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HDAC5Q9UQL6 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms