Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPW5

AGTPBP1, Cytosolic carboxypeptidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGTPBP1Q9UPW5 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
AGTPBP1Q9UPW5 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
AGTPBP1Q9UPW5 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
AGTPBP1Q9UPW5 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
AGTPBP1Q9UPW5 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
AGTPBP1Q9UPW5 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
AGTPBP1Q9UPW5 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
AGTPBP1Q9UPW5 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
AGTPBP1Q9UPW5 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
AGTPBP1Q9UPW5 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
AGTPBP1Q9UPW5 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
AGTPBP1Q9UPW5 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
AGTPBP1Q9UPW5 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
AGTPBP1Q9UPW5 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
AGTPBP1Q9UPW5 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
AGTPBP1Q9UPW5 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
AGTPBP1Q9UPW5 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
AGTPBP1Q9UPW5 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
AGTPBP1Q9UPW5 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
AGTPBP1Q9UPW5 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
AGTPBP1Q9UPW5 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
AGTPBP1Q9UPW5 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
AGTPBP1Q9UPW5 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
AGTPBP1Q9UPW5 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
AGTPBP1Q9UPW5 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
AGTPBP1Q9UPW5 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
AGTPBP1Q9UPW5 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
AGTPBP1Q9UPW5 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
AGTPBP1Q9UPW5 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
AGTPBP1Q9UPW5 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
AGTPBP1Q9UPW5 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
AGTPBP1Q9UPW5 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
AGTPBP1Q9UPW5 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
AGTPBP1Q9UPW5 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
AGTPBP1Q9UPW5 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
AGTPBP1Q9UPW5 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
AGTPBP1Q9UPW5 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
AGTPBP1Q9UPW5 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
AGTPBP1Q9UPW5 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
AGTPBP1Q9UPW5 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
AGTPBP1Q9UPW5 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
AGTPBP1Q9UPW5 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
AGTPBP1Q9UPW5 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
AGTPBP1Q9UPW5 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
AGTPBP1Q9UPW5 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
AGTPBP1Q9UPW5 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
AGTPBP1Q9UPW5 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
AGTPBP1Q9UPW5 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
AGTPBP1Q9UPW5 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
AGTPBP1Q9UPW5 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
AGTPBP1Q9UPW5 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
AGTPBP1Q9UPW5 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
AGTPBP1Q9UPW5 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
AGTPBP1Q9UPW5 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
AGTPBP1Q9UPW5 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
AGTPBP1Q9UPW5 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
AGTPBP1Q9UPW5 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
AGTPBP1Q9UPW5 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
AGTPBP1Q9UPW5 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
AGTPBP1Q9UPW5 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
AGTPBP1Q9UPW5 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
AGTPBP1Q9UPW5 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
AGTPBP1Q9UPW5 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
AGTPBP1Q9UPW5 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
AGTPBP1Q9UPW5 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
AGTPBP1Q9UPW5 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
AGTPBP1Q9UPW5 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
AGTPBP1Q9UPW5 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
AGTPBP1Q9UPW5 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
AGTPBP1Q9UPW5 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
AGTPBP1Q9UPW5 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
AGTPBP1Q9UPW5 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
AGTPBP1Q9UPW5 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
AGTPBP1Q9UPW5 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
AGTPBP1Q9UPW5 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
AGTPBP1Q9UPW5 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
AGTPBP1Q9UPW5 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
AGTPBP1Q9UPW5 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
AGTPBP1Q9UPW5 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
AGTPBP1Q9UPW5 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
AGTPBP1Q9UPW5 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
AGTPBP1Q9UPW5 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
AGTPBP1Q9UPW5 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
AGTPBP1Q9UPW5 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
AGTPBP1Q9UPW5 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
AGTPBP1Q9UPW5 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
AGTPBP1Q9UPW5 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
AGTPBP1Q9UPW5 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
AGTPBP1Q9UPW5 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
AGTPBP1Q9UPW5 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
AGTPBP1Q9UPW5 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
AGTPBP1Q9UPW5 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
AGTPBP1Q9UPW5 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
AGTPBP1Q9UPW5 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
AGTPBP1Q9UPW5 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
AGTPBP1Q9UPW5 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
AGTPBP1Q9UPW5 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
AGTPBP1Q9UPW5 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
AGTPBP1Q9UPW5 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
AGTPBP1Q9UPW5 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms