Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPN6

SCAF8, Protein SCAF8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF8Q9UPN6 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SCAF8Q9UPN6 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SCAF8Q9UPN6 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SCAF8Q9UPN6 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SCAF8Q9UPN6 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SCAF8Q9UPN6 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SCAF8Q9UPN6 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SCAF8Q9UPN6 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SCAF8Q9UPN6 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SCAF8Q9UPN6 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SCAF8Q9UPN6 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SCAF8Q9UPN6 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SCAF8Q9UPN6 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SCAF8Q9UPN6 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SCAF8Q9UPN6 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SCAF8Q9UPN6 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SCAF8Q9UPN6 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SCAF8Q9UPN6 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SCAF8Q9UPN6 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SCAF8Q9UPN6 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SCAF8Q9UPN6 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SCAF8Q9UPN6 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SCAF8Q9UPN6 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SCAF8Q9UPN6 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SCAF8Q9UPN6 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SCAF8Q9UPN6 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SCAF8Q9UPN6 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCAF8Q9UPN6 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCAF8Q9UPN6 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCAF8Q9UPN6 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCAF8Q9UPN6 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCAF8Q9UPN6 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SCAF8Q9UPN6 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCAF8Q9UPN6 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCAF8Q9UPN6 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SCAF8Q9UPN6 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCAF8Q9UPN6 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCAF8Q9UPN6 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCAF8Q9UPN6 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SCAF8Q9UPN6 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCAF8Q9UPN6 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SCAF8Q9UPN6 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCAF8Q9UPN6 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCAF8Q9UPN6 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCAF8Q9UPN6 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCAF8Q9UPN6 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCAF8Q9UPN6 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCAF8Q9UPN6 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCAF8Q9UPN6 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCAF8Q9UPN6 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCAF8Q9UPN6 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCAF8Q9UPN6 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SCAF8Q9UPN6 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCAF8Q9UPN6 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCAF8Q9UPN6 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCAF8Q9UPN6 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SCAF8Q9UPN6 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SCAF8Q9UPN6 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCAF8Q9UPN6 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCAF8Q9UPN6 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCAF8Q9UPN6 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCAF8Q9UPN6 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCAF8Q9UPN6 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCAF8Q9UPN6 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCAF8Q9UPN6 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCAF8Q9UPN6 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCAF8Q9UPN6 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCAF8Q9UPN6 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCAF8Q9UPN6 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCAF8Q9UPN6 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCAF8Q9UPN6 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCAF8Q9UPN6 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCAF8Q9UPN6 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCAF8Q9UPN6 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCAF8Q9UPN6 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCAF8Q9UPN6 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCAF8Q9UPN6 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCAF8Q9UPN6 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCAF8Q9UPN6 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SCAF8Q9UPN6 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SCAF8Q9UPN6 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SCAF8Q9UPN6 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SCAF8Q9UPN6 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SCAF8Q9UPN6 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SCAF8Q9UPN6 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SCAF8Q9UPN6 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SCAF8Q9UPN6 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SCAF8Q9UPN6 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SCAF8Q9UPN6 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SCAF8Q9UPN6 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SCAF8Q9UPN6 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SCAF8Q9UPN6 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SCAF8Q9UPN6 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SCAF8Q9UPN6 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SCAF8Q9UPN6 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SCAF8Q9UPN6 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SCAF8Q9UPN6 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SCAF8Q9UPN6 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SCAF8Q9UPN6 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SCAF8Q9UPN6 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms