Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMS5

PHTF1, Putative homeodomain transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 762 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHTF1Q9UMS5 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PHTF1Q9UMS5 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PHTF1Q9UMS5 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PHTF1Q9UMS5 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PHTF1Q9UMS5 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PHTF1Q9UMS5 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PHTF1Q9UMS5 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PHTF1Q9UMS5 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PHTF1Q9UMS5 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PHTF1Q9UMS5 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PHTF1Q9UMS5 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PHTF1Q9UMS5 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PHTF1Q9UMS5 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PHTF1Q9UMS5 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PHTF1Q9UMS5 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PHTF1Q9UMS5 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PHTF1Q9UMS5 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PHTF1Q9UMS5 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PHTF1Q9UMS5 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PHTF1Q9UMS5 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PHTF1Q9UMS5 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PHTF1Q9UMS5 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PHTF1Q9UMS5 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PHTF1Q9UMS5 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PHTF1Q9UMS5 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PHTF1Q9UMS5 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PHTF1Q9UMS5 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PHTF1Q9UMS5 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PHTF1Q9UMS5 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PHTF1Q9UMS5 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PHTF1Q9UMS5 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PHTF1Q9UMS5 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PHTF1Q9UMS5 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PHTF1Q9UMS5 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PHTF1Q9UMS5 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PHTF1Q9UMS5 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PHTF1Q9UMS5 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PHTF1Q9UMS5 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PHTF1Q9UMS5 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PHTF1Q9UMS5 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PHTF1Q9UMS5 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PHTF1Q9UMS5 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PHTF1Q9UMS5 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PHTF1Q9UMS5 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PHTF1Q9UMS5 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PHTF1Q9UMS5 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PHTF1Q9UMS5 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PHTF1Q9UMS5 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PHTF1Q9UMS5 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PHTF1Q9UMS5 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PHTF1Q9UMS5 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PHTF1Q9UMS5 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PHTF1Q9UMS5 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PHTF1Q9UMS5 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PHTF1Q9UMS5 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PHTF1Q9UMS5 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PHTF1Q9UMS5 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PHTF1Q9UMS5 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PHTF1Q9UMS5 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PHTF1Q9UMS5 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PHTF1Q9UMS5 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PHTF1Q9UMS5 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PHTF1Q9UMS5 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PHTF1Q9UMS5 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PHTF1Q9UMS5 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PHTF1Q9UMS5 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PHTF1Q9UMS5 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PHTF1Q9UMS5 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PHTF1Q9UMS5 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PHTF1Q9UMS5 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PHTF1Q9UMS5 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PHTF1Q9UMS5 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PHTF1Q9UMS5 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PHTF1Q9UMS5 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PHTF1Q9UMS5 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PHTF1Q9UMS5 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PHTF1Q9UMS5 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PHTF1Q9UMS5 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PHTF1Q9UMS5 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PHTF1Q9UMS5 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PHTF1Q9UMS5 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PHTF1Q9UMS5 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PHTF1Q9UMS5 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PHTF1Q9UMS5 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PHTF1Q9UMS5 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PHTF1Q9UMS5 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PHTF1Q9UMS5 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PHTF1Q9UMS5 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PHTF1Q9UMS5 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PHTF1Q9UMS5 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PHTF1Q9UMS5 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PHTF1Q9UMS5 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PHTF1Q9UMS5 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PHTF1Q9UMS5 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PHTF1Q9UMS5 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PHTF1Q9UMS5 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PHTF1Q9UMS5 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PHTF1Q9UMS5 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PHTF1Q9UMS5 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PHTF1Q9UMS5 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms