Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULK4

MED23, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 23, humanhuman

Predictions only

Length 1,368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED23Q9ULK4 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
MED23Q9ULK4 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MED23Q9ULK4 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MED23Q9ULK4 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MED23Q9ULK4 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MED23Q9ULK4 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MED23Q9ULK4 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
MED23Q9ULK4 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MED23Q9ULK4 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MED23Q9ULK4 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MED23Q9ULK4 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MED23Q9ULK4 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MED23Q9ULK4 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MED23Q9ULK4 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MED23Q9ULK4 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MED23Q9ULK4 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MED23Q9ULK4 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MED23Q9ULK4 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MED23Q9ULK4 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MED23Q9ULK4 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MED23Q9ULK4 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MED23Q9ULK4 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MED23Q9ULK4 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MED23Q9ULK4 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MED23Q9ULK4 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MED23Q9ULK4 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MED23Q9ULK4 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MED23Q9ULK4 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MED23Q9ULK4 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MED23Q9ULK4 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MED23Q9ULK4 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MED23Q9ULK4 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MED23Q9ULK4 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MED23Q9ULK4 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MED23Q9ULK4 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MED23Q9ULK4 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MED23Q9ULK4 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MED23Q9ULK4 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MED23Q9ULK4 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MED23Q9ULK4 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
MED23Q9ULK4 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MED23Q9ULK4 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MED23Q9ULK4 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
MED23Q9ULK4 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MED23Q9ULK4 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
MED23Q9ULK4 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MED23Q9ULK4 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MED23Q9ULK4 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
MED23Q9ULK4 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MED23Q9ULK4 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MED23Q9ULK4 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MED23Q9ULK4 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MED23Q9ULK4 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MED23Q9ULK4 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MED23Q9ULK4 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MED23Q9ULK4 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MED23Q9ULK4 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MED23Q9ULK4 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
MED23Q9ULK4 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MED23Q9ULK4 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MED23Q9ULK4 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.68
MED23Q9ULK4 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MED23Q9ULK4 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MED23Q9ULK4 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MED23Q9ULK4 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MED23Q9ULK4 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MED23Q9ULK4 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
MED23Q9ULK4 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MED23Q9ULK4 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MED23Q9ULK4 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MED23Q9ULK4 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MED23Q9ULK4 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MED23Q9ULK4 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MED23Q9ULK4 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MED23Q9ULK4 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MED23Q9ULK4 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
MED23Q9ULK4 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
MED23Q9ULK4 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MED23Q9ULK4 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MED23Q9ULK4 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MED23Q9ULK4 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
MED23Q9ULK4 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MED23Q9ULK4 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MED23Q9ULK4 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MED23Q9ULK4 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MED23Q9ULK4 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MED23Q9ULK4 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MED23Q9ULK4 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MED23Q9ULK4 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MED23Q9ULK4 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MED23Q9ULK4 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MED23Q9ULK4 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MED23Q9ULK4 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MED23Q9ULK4 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MED23Q9ULK4 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
MED23Q9ULK4 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MED23Q9ULK4 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MED23Q9ULK4 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MED23Q9ULK4 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MED23Q9ULK4 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms