Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL41

PNMA3, Paraneoplastic antigen Ma3, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA3Q9UL41 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PNMA3Q9UL41 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PNMA3Q9UL41 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PNMA3Q9UL41 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PNMA3Q9UL41 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PNMA3Q9UL41 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PNMA3Q9UL41 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PNMA3Q9UL41 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PNMA3Q9UL41 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PNMA3Q9UL41 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PNMA3Q9UL41 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PNMA3Q9UL41 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PNMA3Q9UL41 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PNMA3Q9UL41 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PNMA3Q9UL41 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PNMA3Q9UL41 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PNMA3Q9UL41 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PNMA3Q9UL41 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PNMA3Q9UL41 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PNMA3Q9UL41 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PNMA3Q9UL41 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PNMA3Q9UL41 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PNMA3Q9UL41 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PNMA3Q9UL41 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PNMA3Q9UL41 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PNMA3Q9UL41 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PNMA3Q9UL41 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PNMA3Q9UL41 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PNMA3Q9UL41 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PNMA3Q9UL41 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PNMA3Q9UL41 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PNMA3Q9UL41 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PNMA3Q9UL41 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PNMA3Q9UL41 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PNMA3Q9UL41 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PNMA3Q9UL41 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PNMA3Q9UL41 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PNMA3Q9UL41 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PNMA3Q9UL41 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PNMA3Q9UL41 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PNMA3Q9UL41 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PNMA3Q9UL41 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PNMA3Q9UL41 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PNMA3Q9UL41 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PNMA3Q9UL41 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PNMA3Q9UL41 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PNMA3Q9UL41 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PNMA3Q9UL41 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PNMA3Q9UL41 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PNMA3Q9UL41 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PNMA3Q9UL41 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PNMA3Q9UL41 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PNMA3Q9UL41 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PNMA3Q9UL41 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
PNMA3Q9UL41 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PNMA3Q9UL41 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PNMA3Q9UL41 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PNMA3Q9UL41 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PNMA3Q9UL41 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PNMA3Q9UL41 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PNMA3Q9UL41 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PNMA3Q9UL41 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PNMA3Q9UL41 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PNMA3Q9UL41 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PNMA3Q9UL41 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PNMA3Q9UL41 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PNMA3Q9UL41 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PNMA3Q9UL41 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PNMA3Q9UL41 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PNMA3Q9UL41 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PNMA3Q9UL41 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PNMA3Q9UL41 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PNMA3Q9UL41 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PNMA3Q9UL41 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PNMA3Q9UL41 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PNMA3Q9UL41 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PNMA3Q9UL41 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PNMA3Q9UL41 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PNMA3Q9UL41 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PNMA3Q9UL41 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PNMA3Q9UL41 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PNMA3Q9UL41 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PNMA3Q9UL41 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PNMA3Q9UL41 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PNMA3Q9UL41 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PNMA3Q9UL41 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PNMA3Q9UL41 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PNMA3Q9UL41 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PNMA3Q9UL41 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PNMA3Q9UL41 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PNMA3Q9UL41 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PNMA3Q9UL41 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PNMA3Q9UL41 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PNMA3Q9UL41 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PNMA3Q9UL41 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PNMA3Q9UL41 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PNMA3Q9UL41 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PNMA3Q9UL41 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PNMA3Q9UL41 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PNMA3Q9UL41 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms