Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT1

TUBD1, Tubulin delta chain, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBD1Q9UJT1 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TUBD1Q9UJT1 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
TUBD1Q9UJT1 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TUBD1Q9UJT1 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
TUBD1Q9UJT1 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
TUBD1Q9UJT1 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TUBD1Q9UJT1 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TUBD1Q9UJT1 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TUBD1Q9UJT1 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TUBD1Q9UJT1 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TUBD1Q9UJT1 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TUBD1Q9UJT1 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TUBD1Q9UJT1 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
TUBD1Q9UJT1 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TUBD1Q9UJT1 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TUBD1Q9UJT1 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TUBD1Q9UJT1 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TUBD1Q9UJT1 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TUBD1Q9UJT1 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TUBD1Q9UJT1 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TUBD1Q9UJT1 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TUBD1Q9UJT1 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TUBD1Q9UJT1 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TUBD1Q9UJT1 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TUBD1Q9UJT1 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TUBD1Q9UJT1 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TUBD1Q9UJT1 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TUBD1Q9UJT1 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TUBD1Q9UJT1 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TUBD1Q9UJT1 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TUBD1Q9UJT1 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TUBD1Q9UJT1 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TUBD1Q9UJT1 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TUBD1Q9UJT1 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TUBD1Q9UJT1 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TUBD1Q9UJT1 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TUBD1Q9UJT1 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TUBD1Q9UJT1 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TUBD1Q9UJT1 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TUBD1Q9UJT1 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TUBD1Q9UJT1 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TUBD1Q9UJT1 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TUBD1Q9UJT1 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TUBD1Q9UJT1 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TUBD1Q9UJT1 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TUBD1Q9UJT1 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TUBD1Q9UJT1 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TUBD1Q9UJT1 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TUBD1Q9UJT1 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TUBD1Q9UJT1 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TUBD1Q9UJT1 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TUBD1Q9UJT1 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TUBD1Q9UJT1 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TUBD1Q9UJT1 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TUBD1Q9UJT1 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TUBD1Q9UJT1 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TUBD1Q9UJT1 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TUBD1Q9UJT1 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
TUBD1Q9UJT1 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TUBD1Q9UJT1 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TUBD1Q9UJT1 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TUBD1Q9UJT1 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TUBD1Q9UJT1 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TUBD1Q9UJT1 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TUBD1Q9UJT1 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TUBD1Q9UJT1 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TUBD1Q9UJT1 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TUBD1Q9UJT1 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TUBD1Q9UJT1 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TUBD1Q9UJT1 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TUBD1Q9UJT1 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TUBD1Q9UJT1 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TUBD1Q9UJT1 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TUBD1Q9UJT1 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TUBD1Q9UJT1 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TUBD1Q9UJT1 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TUBD1Q9UJT1 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TUBD1Q9UJT1 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TUBD1Q9UJT1 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
TUBD1Q9UJT1 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TUBD1Q9UJT1 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TUBD1Q9UJT1 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TUBD1Q9UJT1 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TUBD1Q9UJT1 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TUBD1Q9UJT1 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TUBD1Q9UJT1 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TUBD1Q9UJT1 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TUBD1Q9UJT1 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TUBD1Q9UJT1 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TUBD1Q9UJT1 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TUBD1Q9UJT1 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TUBD1Q9UJT1 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TUBD1Q9UJT1 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TUBD1Q9UJT1 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TUBD1Q9UJT1 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TUBD1Q9UJT1 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TUBD1Q9UJT1 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TUBD1Q9UJT1 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
TUBD1Q9UJT1 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TUBD1Q9UJT1 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms