Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIS9

MBD1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD1Q9UIS9 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MBD1Q9UIS9 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
MBD1Q9UIS9 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
MBD1Q9UIS9 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MBD1Q9UIS9 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
MBD1Q9UIS9 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MBD1Q9UIS9 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MBD1Q9UIS9 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MBD1Q9UIS9 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MBD1Q9UIS9 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MBD1Q9UIS9 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MBD1Q9UIS9 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
MBD1Q9UIS9 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
MBD1Q9UIS9 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MBD1Q9UIS9 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MBD1Q9UIS9 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MBD1Q9UIS9 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
MBD1Q9UIS9 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MBD1Q9UIS9 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
MBD1Q9UIS9 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MBD1Q9UIS9 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MBD1Q9UIS9 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
MBD1Q9UIS9 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MBD1Q9UIS9 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MBD1Q9UIS9 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MBD1Q9UIS9 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MBD1Q9UIS9 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MBD1Q9UIS9 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MBD1Q9UIS9 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MBD1Q9UIS9 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MBD1Q9UIS9 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MBD1Q9UIS9 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MBD1Q9UIS9 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
MBD1Q9UIS9 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
MBD1Q9UIS9 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MBD1Q9UIS9 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
MBD1Q9UIS9 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MBD1Q9UIS9 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MBD1Q9UIS9 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
MBD1Q9UIS9 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
MBD1Q9UIS9 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
MBD1Q9UIS9 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MBD1Q9UIS9 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
MBD1Q9UIS9 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
MBD1Q9UIS9 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MBD1Q9UIS9 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
MBD1Q9UIS9 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
MBD1Q9UIS9 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MBD1Q9UIS9 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
MBD1Q9UIS9 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MBD1Q9UIS9 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MBD1Q9UIS9 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MBD1Q9UIS9 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
MBD1Q9UIS9 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
MBD1Q9UIS9 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MBD1Q9UIS9 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
MBD1Q9UIS9 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
MBD1Q9UIS9 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
MBD1Q9UIS9 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
MBD1Q9UIS9 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
MBD1Q9UIS9 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
MBD1Q9UIS9 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
MBD1Q9UIS9 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MBD1Q9UIS9 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MBD1Q9UIS9 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MBD1Q9UIS9 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MBD1Q9UIS9 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MBD1Q9UIS9 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MBD1Q9UIS9 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
MBD1Q9UIS9 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
MBD1Q9UIS9 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
MBD1Q9UIS9 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
MBD1Q9UIS9 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
MBD1Q9UIS9 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
MBD1Q9UIS9 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
MBD1Q9UIS9 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
MBD1Q9UIS9 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
MBD1Q9UIS9 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
MBD1Q9UIS9 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
MBD1Q9UIS9 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
MBD1Q9UIS9 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
MBD1Q9UIS9 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
MBD1Q9UIS9 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
MBD1Q9UIS9 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
MBD1Q9UIS9 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
MBD1Q9UIS9 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
MBD1Q9UIS9 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
MBD1Q9UIS9 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
MBD1Q9UIS9 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
MBD1Q9UIS9 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
MBD1Q9UIS9 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
MBD1Q9UIS9 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
MBD1Q9UIS9 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
MBD1Q9UIS9 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
MBD1Q9UIS9 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
MBD1Q9UIS9 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
MBD1Q9UIS9 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
MBD1Q9UIS9 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
MBD1Q9UIS9 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
MBD1Q9UIS9 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms