Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU7

DBF4, Protein DBF4 homolog A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 674 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DBF4Q9UBU7 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
DBF4Q9UBU7 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
DBF4Q9UBU7 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
DBF4Q9UBU7 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
DBF4Q9UBU7 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
DBF4Q9UBU7 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
DBF4Q9UBU7 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
DBF4Q9UBU7 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
DBF4Q9UBU7 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
DBF4Q9UBU7 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
DBF4Q9UBU7 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
DBF4Q9UBU7 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
DBF4Q9UBU7 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
DBF4Q9UBU7 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
DBF4Q9UBU7 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
DBF4Q9UBU7 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
DBF4Q9UBU7 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
DBF4Q9UBU7 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
DBF4Q9UBU7 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
DBF4Q9UBU7 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
DBF4Q9UBU7 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
DBF4Q9UBU7 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
DBF4Q9UBU7 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
DBF4Q9UBU7 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
DBF4Q9UBU7 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
DBF4Q9UBU7 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
DBF4Q9UBU7 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
DBF4Q9UBU7 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
DBF4Q9UBU7 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC26.33■■□□□ 1.81
DBF4Q9UBU7 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
DBF4Q9UBU7 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
DBF4Q9UBU7 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
DBF4Q9UBU7 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
DBF4Q9UBU7 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
DBF4Q9UBU7 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
DBF4Q9UBU7 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
DBF4Q9UBU7 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
DBF4Q9UBU7 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
DBF4Q9UBU7 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
DBF4Q9UBU7 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
DBF4Q9UBU7 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
DBF4Q9UBU7 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
DBF4Q9UBU7 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
DBF4Q9UBU7 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
DBF4Q9UBU7 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
DBF4Q9UBU7 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
DBF4Q9UBU7 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC26.32■■□□□ 1.8
DBF4Q9UBU7 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
DBF4Q9UBU7 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
DBF4Q9UBU7 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
DBF4Q9UBU7 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
DBF4Q9UBU7 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
DBF4Q9UBU7 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
DBF4Q9UBU7 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
DBF4Q9UBU7 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
DBF4Q9UBU7 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
DBF4Q9UBU7 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
DBF4Q9UBU7 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
DBF4Q9UBU7 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
DBF4Q9UBU7 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
DBF4Q9UBU7 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
DBF4Q9UBU7 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
DBF4Q9UBU7 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
DBF4Q9UBU7 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
DBF4Q9UBU7 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
DBF4Q9UBU7 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
DBF4Q9UBU7 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
DBF4Q9UBU7 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
DBF4Q9UBU7 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
DBF4Q9UBU7 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
DBF4Q9UBU7 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
DBF4Q9UBU7 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
DBF4Q9UBU7 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
DBF4Q9UBU7 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
DBF4Q9UBU7 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
DBF4Q9UBU7 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
DBF4Q9UBU7 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC26.29■■□□□ 1.8
DBF4Q9UBU7 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
DBF4Q9UBU7 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
DBF4Q9UBU7 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
DBF4Q9UBU7 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
DBF4Q9UBU7 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
DBF4Q9UBU7 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
DBF4Q9UBU7 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
DBF4Q9UBU7 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
DBF4Q9UBU7 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
DBF4Q9UBU7 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
DBF4Q9UBU7 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
DBF4Q9UBU7 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
DBF4Q9UBU7 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
DBF4Q9UBU7 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
DBF4Q9UBU7 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
DBF4Q9UBU7 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
DBF4Q9UBU7 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
DBF4Q9UBU7 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
DBF4Q9UBU7 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
DBF4Q9UBU7 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
DBF4Q9UBU7 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
DBF4Q9UBU7 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
DBF4Q9UBU7 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms