Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

Predictions only

Length 1,018 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
USP35Q9P2H5 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
USP35Q9P2H5 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
USP35Q9P2H5 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
USP35Q9P2H5 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
USP35Q9P2H5 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
USP35Q9P2H5 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
USP35Q9P2H5 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
USP35Q9P2H5 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
USP35Q9P2H5 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
USP35Q9P2H5 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
USP35Q9P2H5 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
USP35Q9P2H5 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
USP35Q9P2H5 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
USP35Q9P2H5 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
USP35Q9P2H5 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
USP35Q9P2H5 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
USP35Q9P2H5 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
USP35Q9P2H5 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
USP35Q9P2H5 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
USP35Q9P2H5 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
USP35Q9P2H5 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
USP35Q9P2H5 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
USP35Q9P2H5 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
USP35Q9P2H5 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
USP35Q9P2H5 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
USP35Q9P2H5 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
USP35Q9P2H5 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
USP35Q9P2H5 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
USP35Q9P2H5 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
USP35Q9P2H5 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
USP35Q9P2H5 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
USP35Q9P2H5 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
USP35Q9P2H5 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
USP35Q9P2H5 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
USP35Q9P2H5 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
USP35Q9P2H5 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
USP35Q9P2H5 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
USP35Q9P2H5 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
USP35Q9P2H5 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
USP35Q9P2H5 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
USP35Q9P2H5 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
USP35Q9P2H5 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
USP35Q9P2H5 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
USP35Q9P2H5 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC27.9■■■□□ 2.06
USP35Q9P2H5 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
USP35Q9P2H5 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
USP35Q9P2H5 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
USP35Q9P2H5 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
USP35Q9P2H5 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
USP35Q9P2H5 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
USP35Q9P2H5 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
USP35Q9P2H5 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
USP35Q9P2H5 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
USP35Q9P2H5 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
USP35Q9P2H5 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
USP35Q9P2H5 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
USP35Q9P2H5 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
USP35Q9P2H5 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
USP35Q9P2H5 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
USP35Q9P2H5 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
USP35Q9P2H5 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
USP35Q9P2H5 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
USP35Q9P2H5 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
USP35Q9P2H5 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
USP35Q9P2H5 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
USP35Q9P2H5 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
USP35Q9P2H5 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
USP35Q9P2H5 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
USP35Q9P2H5 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
USP35Q9P2H5 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.88■■■□□ 2.05
USP35Q9P2H5 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
USP35Q9P2H5 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
USP35Q9P2H5 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
USP35Q9P2H5 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
USP35Q9P2H5 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
USP35Q9P2H5 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
USP35Q9P2H5 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
USP35Q9P2H5 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
USP35Q9P2H5 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
USP35Q9P2H5 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
USP35Q9P2H5 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
USP35Q9P2H5 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
USP35Q9P2H5 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
USP35Q9P2H5 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
USP35Q9P2H5 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
USP35Q9P2H5 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
USP35Q9P2H5 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
USP35Q9P2H5 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
USP35Q9P2H5 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
USP35Q9P2H5 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
USP35Q9P2H5 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
USP35Q9P2H5 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
USP35Q9P2H5 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
USP35Q9P2H5 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
USP35Q9P2H5 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
USP35Q9P2H5 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
USP35Q9P2H5 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
USP35Q9P2H5 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
USP35Q9P2H5 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms