Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1F3

ABRACL, Costars family protein ABRACL, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABRACLQ9P1F3 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ABRACLQ9P1F3 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ABRACLQ9P1F3 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ABRACLQ9P1F3 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ABRACLQ9P1F3 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ABRACLQ9P1F3 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ABRACLQ9P1F3 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ABRACLQ9P1F3 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ABRACLQ9P1F3 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ABRACLQ9P1F3 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ABRACLQ9P1F3 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ABRACLQ9P1F3 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ABRACLQ9P1F3 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ABRACLQ9P1F3 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ABRACLQ9P1F3 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ABRACLQ9P1F3 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ABRACLQ9P1F3 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ABRACLQ9P1F3 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ABRACLQ9P1F3 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ABRACLQ9P1F3 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ABRACLQ9P1F3 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ABRACLQ9P1F3 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ABRACLQ9P1F3 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ABRACLQ9P1F3 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ABRACLQ9P1F3 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ABRACLQ9P1F3 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ABRACLQ9P1F3 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ABRACLQ9P1F3 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ABRACLQ9P1F3 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ABRACLQ9P1F3 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ABRACLQ9P1F3 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ABRACLQ9P1F3 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ABRACLQ9P1F3 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ABRACLQ9P1F3 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ABRACLQ9P1F3 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ABRACLQ9P1F3 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ABRACLQ9P1F3 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ABRACLQ9P1F3 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ABRACLQ9P1F3 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ABRACLQ9P1F3 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ABRACLQ9P1F3 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ABRACLQ9P1F3 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ABRACLQ9P1F3 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ABRACLQ9P1F3 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ABRACLQ9P1F3 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ABRACLQ9P1F3 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ABRACLQ9P1F3 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ABRACLQ9P1F3 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ABRACLQ9P1F3 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ABRACLQ9P1F3 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ABRACLQ9P1F3 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ABRACLQ9P1F3 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ABRACLQ9P1F3 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ABRACLQ9P1F3 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ABRACLQ9P1F3 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ABRACLQ9P1F3 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ABRACLQ9P1F3 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ABRACLQ9P1F3 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ABRACLQ9P1F3 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ABRACLQ9P1F3 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ABRACLQ9P1F3 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ABRACLQ9P1F3 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ABRACLQ9P1F3 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ABRACLQ9P1F3 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ABRACLQ9P1F3 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ABRACLQ9P1F3 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ABRACLQ9P1F3 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ABRACLQ9P1F3 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ABRACLQ9P1F3 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ABRACLQ9P1F3 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ABRACLQ9P1F3 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ABRACLQ9P1F3 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ABRACLQ9P1F3 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ABRACLQ9P1F3 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ABRACLQ9P1F3 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ABRACLQ9P1F3 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ABRACLQ9P1F3 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ABRACLQ9P1F3 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ABRACLQ9P1F3 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ABRACLQ9P1F3 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ABRACLQ9P1F3 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ABRACLQ9P1F3 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ABRACLQ9P1F3 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ABRACLQ9P1F3 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ABRACLQ9P1F3 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ABRACLQ9P1F3 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ABRACLQ9P1F3 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ABRACLQ9P1F3 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ABRACLQ9P1F3 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ABRACLQ9P1F3 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ABRACLQ9P1F3 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ABRACLQ9P1F3 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ABRACLQ9P1F3 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ABRACLQ9P1F3 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ABRACLQ9P1F3 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ABRACLQ9P1F3 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ABRACLQ9P1F3 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ABRACLQ9P1F3 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ABRACLQ9P1F3 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ABRACLQ9P1F3 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms