Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU53

GINM1, Glycoprotein integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINM1Q9NU53 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GINM1Q9NU53 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GINM1Q9NU53 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GINM1Q9NU53 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GINM1Q9NU53 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GINM1Q9NU53 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GINM1Q9NU53 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GINM1Q9NU53 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GINM1Q9NU53 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GINM1Q9NU53 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GINM1Q9NU53 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GINM1Q9NU53 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GINM1Q9NU53 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GINM1Q9NU53 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GINM1Q9NU53 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GINM1Q9NU53 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GINM1Q9NU53 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GINM1Q9NU53 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GINM1Q9NU53 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GINM1Q9NU53 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
GINM1Q9NU53 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GINM1Q9NU53 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GINM1Q9NU53 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GINM1Q9NU53 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GINM1Q9NU53 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GINM1Q9NU53 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GINM1Q9NU53 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GINM1Q9NU53 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GINM1Q9NU53 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GINM1Q9NU53 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GINM1Q9NU53 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GINM1Q9NU53 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GINM1Q9NU53 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GINM1Q9NU53 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GINM1Q9NU53 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GINM1Q9NU53 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GINM1Q9NU53 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
GINM1Q9NU53 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GINM1Q9NU53 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GINM1Q9NU53 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GINM1Q9NU53 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GINM1Q9NU53 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GINM1Q9NU53 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GINM1Q9NU53 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GINM1Q9NU53 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GINM1Q9NU53 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GINM1Q9NU53 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GINM1Q9NU53 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GINM1Q9NU53 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GINM1Q9NU53 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GINM1Q9NU53 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GINM1Q9NU53 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
GINM1Q9NU53 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GINM1Q9NU53 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GINM1Q9NU53 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GINM1Q9NU53 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GINM1Q9NU53 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GINM1Q9NU53 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GINM1Q9NU53 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GINM1Q9NU53 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GINM1Q9NU53 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GINM1Q9NU53 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GINM1Q9NU53 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GINM1Q9NU53 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GINM1Q9NU53 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GINM1Q9NU53 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GINM1Q9NU53 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GINM1Q9NU53 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GINM1Q9NU53 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GINM1Q9NU53 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GINM1Q9NU53 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GINM1Q9NU53 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GINM1Q9NU53 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GINM1Q9NU53 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GINM1Q9NU53 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GINM1Q9NU53 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GINM1Q9NU53 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GINM1Q9NU53 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GINM1Q9NU53 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GINM1Q9NU53 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GINM1Q9NU53 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
GINM1Q9NU53 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
GINM1Q9NU53 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GINM1Q9NU53 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GINM1Q9NU53 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
GINM1Q9NU53 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GINM1Q9NU53 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
GINM1Q9NU53 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
GINM1Q9NU53 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
GINM1Q9NU53 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
GINM1Q9NU53 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
GINM1Q9NU53 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GINM1Q9NU53 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GINM1Q9NU53 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GINM1Q9NU53 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GINM1Q9NU53 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GINM1Q9NU53 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GINM1Q9NU53 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GINM1Q9NU53 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GINM1Q9NU53 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms