Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRF9

POLE3, DNA polymerase epsilon subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLE3Q9NRF9 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
POLE3Q9NRF9 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
POLE3Q9NRF9 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
POLE3Q9NRF9 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
POLE3Q9NRF9 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLE3Q9NRF9 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLE3Q9NRF9 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLE3Q9NRF9 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLE3Q9NRF9 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLE3Q9NRF9 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLE3Q9NRF9 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLE3Q9NRF9 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLE3Q9NRF9 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLE3Q9NRF9 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLE3Q9NRF9 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLE3Q9NRF9 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLE3Q9NRF9 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLE3Q9NRF9 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
POLE3Q9NRF9 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLE3Q9NRF9 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLE3Q9NRF9 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLE3Q9NRF9 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLE3Q9NRF9 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLE3Q9NRF9 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
POLE3Q9NRF9 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
POLE3Q9NRF9 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLE3Q9NRF9 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLE3Q9NRF9 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLE3Q9NRF9 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLE3Q9NRF9 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLE3Q9NRF9 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLE3Q9NRF9 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLE3Q9NRF9 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLE3Q9NRF9 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLE3Q9NRF9 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLE3Q9NRF9 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLE3Q9NRF9 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLE3Q9NRF9 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLE3Q9NRF9 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLE3Q9NRF9 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLE3Q9NRF9 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLE3Q9NRF9 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLE3Q9NRF9 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLE3Q9NRF9 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLE3Q9NRF9 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLE3Q9NRF9 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLE3Q9NRF9 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLE3Q9NRF9 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLE3Q9NRF9 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLE3Q9NRF9 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLE3Q9NRF9 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLE3Q9NRF9 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLE3Q9NRF9 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLE3Q9NRF9 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLE3Q9NRF9 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
POLE3Q9NRF9 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLE3Q9NRF9 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLE3Q9NRF9 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLE3Q9NRF9 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLE3Q9NRF9 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLE3Q9NRF9 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLE3Q9NRF9 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLE3Q9NRF9 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLE3Q9NRF9 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLE3Q9NRF9 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLE3Q9NRF9 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLE3Q9NRF9 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLE3Q9NRF9 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLE3Q9NRF9 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLE3Q9NRF9 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLE3Q9NRF9 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLE3Q9NRF9 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLE3Q9NRF9 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLE3Q9NRF9 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLE3Q9NRF9 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLE3Q9NRF9 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLE3Q9NRF9 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLE3Q9NRF9 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLE3Q9NRF9 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLE3Q9NRF9 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLE3Q9NRF9 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLE3Q9NRF9 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLE3Q9NRF9 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLE3Q9NRF9 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLE3Q9NRF9 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLE3Q9NRF9 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLE3Q9NRF9 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
POLE3Q9NRF9 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLE3Q9NRF9 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLE3Q9NRF9 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLE3Q9NRF9 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLE3Q9NRF9 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLE3Q9NRF9 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLE3Q9NRF9 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLE3Q9NRF9 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLE3Q9NRF9 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLE3Q9NRF9 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLE3Q9NRF9 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLE3Q9NRF9 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLE3Q9NRF9 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms