Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR96

TLR9, Toll-like receptor 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR9Q9NR96 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TLR9Q9NR96 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TLR9Q9NR96 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TLR9Q9NR96 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TLR9Q9NR96 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TLR9Q9NR96 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TLR9Q9NR96 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TLR9Q9NR96 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TLR9Q9NR96 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TLR9Q9NR96 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TLR9Q9NR96 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TLR9Q9NR96 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TLR9Q9NR96 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TLR9Q9NR96 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TLR9Q9NR96 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TLR9Q9NR96 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TLR9Q9NR96 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TLR9Q9NR96 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TLR9Q9NR96 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TLR9Q9NR96 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TLR9Q9NR96 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TLR9Q9NR96 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TLR9Q9NR96 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TLR9Q9NR96 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TLR9Q9NR96 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TLR9Q9NR96 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TLR9Q9NR96 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TLR9Q9NR96 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TLR9Q9NR96 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TLR9Q9NR96 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TLR9Q9NR96 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TLR9Q9NR96 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TLR9Q9NR96 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TLR9Q9NR96 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TLR9Q9NR96 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TLR9Q9NR96 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TLR9Q9NR96 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TLR9Q9NR96 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TLR9Q9NR96 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TLR9Q9NR96 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TLR9Q9NR96 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TLR9Q9NR96 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TLR9Q9NR96 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TLR9Q9NR96 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
TLR9Q9NR96 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TLR9Q9NR96 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TLR9Q9NR96 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TLR9Q9NR96 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TLR9Q9NR96 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TLR9Q9NR96 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TLR9Q9NR96 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TLR9Q9NR96 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TLR9Q9NR96 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TLR9Q9NR96 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TLR9Q9NR96 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TLR9Q9NR96 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TLR9Q9NR96 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TLR9Q9NR96 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TLR9Q9NR96 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TLR9Q9NR96 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TLR9Q9NR96 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TLR9Q9NR96 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TLR9Q9NR96 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TLR9Q9NR96 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TLR9Q9NR96 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TLR9Q9NR96 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TLR9Q9NR96 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TLR9Q9NR96 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TLR9Q9NR96 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TLR9Q9NR96 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TLR9Q9NR96 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TLR9Q9NR96 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TLR9Q9NR96 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TLR9Q9NR96 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TLR9Q9NR96 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TLR9Q9NR96 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TLR9Q9NR96 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TLR9Q9NR96 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TLR9Q9NR96 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TLR9Q9NR96 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TLR9Q9NR96 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TLR9Q9NR96 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TLR9Q9NR96 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TLR9Q9NR96 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TLR9Q9NR96 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TLR9Q9NR96 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TLR9Q9NR96 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TLR9Q9NR96 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TLR9Q9NR96 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TLR9Q9NR96 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TLR9Q9NR96 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TLR9Q9NR96 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TLR9Q9NR96 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TLR9Q9NR96 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TLR9Q9NR96 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TLR9Q9NR96 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TLR9Q9NR96 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TLR9Q9NR96 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TLR9Q9NR96 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TLR9Q9NR96 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms