Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR81

ARHGEF3, Rho guanine nucleotide exchange factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF3Q9NR81 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARHGEF3Q9NR81 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARHGEF3Q9NR81 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARHGEF3Q9NR81 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARHGEF3Q9NR81 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARHGEF3Q9NR81 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARHGEF3Q9NR81 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARHGEF3Q9NR81 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARHGEF3Q9NR81 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARHGEF3Q9NR81 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARHGEF3Q9NR81 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARHGEF3Q9NR81 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
ARHGEF3Q9NR81 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARHGEF3Q9NR81 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARHGEF3Q9NR81 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARHGEF3Q9NR81 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ARHGEF3Q9NR81 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ARHGEF3Q9NR81 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ARHGEF3Q9NR81 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ARHGEF3Q9NR81 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ARHGEF3Q9NR81 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ARHGEF3Q9NR81 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ARHGEF3Q9NR81 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ARHGEF3Q9NR81 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ARHGEF3Q9NR81 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ARHGEF3Q9NR81 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ARHGEF3Q9NR81 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ARHGEF3Q9NR81 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ARHGEF3Q9NR81 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ARHGEF3Q9NR81 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ARHGEF3Q9NR81 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ARHGEF3Q9NR81 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ARHGEF3Q9NR81 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ARHGEF3Q9NR81 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ARHGEF3Q9NR81 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ARHGEF3Q9NR81 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ARHGEF3Q9NR81 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ARHGEF3Q9NR81 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ARHGEF3Q9NR81 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ARHGEF3Q9NR81 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ARHGEF3Q9NR81 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ARHGEF3Q9NR81 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ARHGEF3Q9NR81 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ARHGEF3Q9NR81 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ARHGEF3Q9NR81 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ARHGEF3Q9NR81 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ARHGEF3Q9NR81 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ARHGEF3Q9NR81 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ARHGEF3Q9NR81 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ARHGEF3Q9NR81 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ARHGEF3Q9NR81 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ARHGEF3Q9NR81 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ARHGEF3Q9NR81 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ARHGEF3Q9NR81 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ARHGEF3Q9NR81 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ARHGEF3Q9NR81 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ARHGEF3Q9NR81 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ARHGEF3Q9NR81 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
ARHGEF3Q9NR81 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ARHGEF3Q9NR81 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ARHGEF3Q9NR81 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ARHGEF3Q9NR81 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ARHGEF3Q9NR81 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ARHGEF3Q9NR81 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ARHGEF3Q9NR81 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ARHGEF3Q9NR81 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ARHGEF3Q9NR81 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ARHGEF3Q9NR81 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ARHGEF3Q9NR81 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ARHGEF3Q9NR81 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ARHGEF3Q9NR81 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ARHGEF3Q9NR81 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ARHGEF3Q9NR81 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ARHGEF3Q9NR81 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ARHGEF3Q9NR81 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ARHGEF3Q9NR81 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ARHGEF3Q9NR81 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ARHGEF3Q9NR81 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ARHGEF3Q9NR81 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ARHGEF3Q9NR81 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ARHGEF3Q9NR81 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ARHGEF3Q9NR81 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ARHGEF3Q9NR81 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ARHGEF3Q9NR81 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ARHGEF3Q9NR81 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ARHGEF3Q9NR81 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ARHGEF3Q9NR81 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
ARHGEF3Q9NR81 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ARHGEF3Q9NR81 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
ARHGEF3Q9NR81 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
ARHGEF3Q9NR81 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
ARHGEF3Q9NR81 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ARHGEF3Q9NR81 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ARHGEF3Q9NR81 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ARHGEF3Q9NR81 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ARHGEF3Q9NR81 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ARHGEF3Q9NR81 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ARHGEF3Q9NR81 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ARHGEF3Q9NR81 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ARHGEF3Q9NR81 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms