Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQW8

CNGB3, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB3Q9NQW8 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CNGB3Q9NQW8 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CNGB3Q9NQW8 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CNGB3Q9NQW8 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CNGB3Q9NQW8 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CNGB3Q9NQW8 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CNGB3Q9NQW8 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CNGB3Q9NQW8 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CNGB3Q9NQW8 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CNGB3Q9NQW8 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CNGB3Q9NQW8 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CNGB3Q9NQW8 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CNGB3Q9NQW8 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CNGB3Q9NQW8 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CNGB3Q9NQW8 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CNGB3Q9NQW8 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CNGB3Q9NQW8 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CNGB3Q9NQW8 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CNGB3Q9NQW8 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CNGB3Q9NQW8 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CNGB3Q9NQW8 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CNGB3Q9NQW8 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CNGB3Q9NQW8 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CNGB3Q9NQW8 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CNGB3Q9NQW8 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CNGB3Q9NQW8 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CNGB3Q9NQW8 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CNGB3Q9NQW8 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CNGB3Q9NQW8 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CNGB3Q9NQW8 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CNGB3Q9NQW8 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CNGB3Q9NQW8 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CNGB3Q9NQW8 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CNGB3Q9NQW8 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CNGB3Q9NQW8 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CNGB3Q9NQW8 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CNGB3Q9NQW8 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CNGB3Q9NQW8 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CNGB3Q9NQW8 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CNGB3Q9NQW8 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CNGB3Q9NQW8 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CNGB3Q9NQW8 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CNGB3Q9NQW8 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CNGB3Q9NQW8 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CNGB3Q9NQW8 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CNGB3Q9NQW8 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CNGB3Q9NQW8 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CNGB3Q9NQW8 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CNGB3Q9NQW8 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CNGB3Q9NQW8 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CNGB3Q9NQW8 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CNGB3Q9NQW8 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CNGB3Q9NQW8 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CNGB3Q9NQW8 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CNGB3Q9NQW8 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CNGB3Q9NQW8 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CNGB3Q9NQW8 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CNGB3Q9NQW8 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CNGB3Q9NQW8 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CNGB3Q9NQW8 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CNGB3Q9NQW8 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CNGB3Q9NQW8 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CNGB3Q9NQW8 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CNGB3Q9NQW8 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CNGB3Q9NQW8 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CNGB3Q9NQW8 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CNGB3Q9NQW8 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CNGB3Q9NQW8 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CNGB3Q9NQW8 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CNGB3Q9NQW8 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CNGB3Q9NQW8 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CNGB3Q9NQW8 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CNGB3Q9NQW8 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CNGB3Q9NQW8 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CNGB3Q9NQW8 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CNGB3Q9NQW8 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CNGB3Q9NQW8 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CNGB3Q9NQW8 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CNGB3Q9NQW8 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CNGB3Q9NQW8 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CNGB3Q9NQW8 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CNGB3Q9NQW8 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CNGB3Q9NQW8 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CNGB3Q9NQW8 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CNGB3Q9NQW8 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CNGB3Q9NQW8 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CNGB3Q9NQW8 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CNGB3Q9NQW8 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CNGB3Q9NQW8 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CNGB3Q9NQW8 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CNGB3Q9NQW8 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CNGB3Q9NQW8 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CNGB3Q9NQW8 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNGB3Q9NQW8 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNGB3Q9NQW8 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNGB3Q9NQW8 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNGB3Q9NQW8 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNGB3Q9NQW8 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNGB3Q9NQW8 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNGB3Q9NQW8 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms