Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ35

NRIP3, Nuclear receptor-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP3Q9NQ35 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NRIP3Q9NQ35 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NRIP3Q9NQ35 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NRIP3Q9NQ35 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NRIP3Q9NQ35 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NRIP3Q9NQ35 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NRIP3Q9NQ35 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NRIP3Q9NQ35 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NRIP3Q9NQ35 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NRIP3Q9NQ35 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NRIP3Q9NQ35 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NRIP3Q9NQ35 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NRIP3Q9NQ35 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NRIP3Q9NQ35 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NRIP3Q9NQ35 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NRIP3Q9NQ35 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NRIP3Q9NQ35 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NRIP3Q9NQ35 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NRIP3Q9NQ35 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NRIP3Q9NQ35 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NRIP3Q9NQ35 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
NRIP3Q9NQ35 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NRIP3Q9NQ35 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NRIP3Q9NQ35 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NRIP3Q9NQ35 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NRIP3Q9NQ35 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
NRIP3Q9NQ35 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NRIP3Q9NQ35 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NRIP3Q9NQ35 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NRIP3Q9NQ35 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NRIP3Q9NQ35 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NRIP3Q9NQ35 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NRIP3Q9NQ35 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NRIP3Q9NQ35 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NRIP3Q9NQ35 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NRIP3Q9NQ35 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NRIP3Q9NQ35 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NRIP3Q9NQ35 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NRIP3Q9NQ35 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NRIP3Q9NQ35 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NRIP3Q9NQ35 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NRIP3Q9NQ35 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
NRIP3Q9NQ35 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NRIP3Q9NQ35 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
NRIP3Q9NQ35 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NRIP3Q9NQ35 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NRIP3Q9NQ35 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NRIP3Q9NQ35 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NRIP3Q9NQ35 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NRIP3Q9NQ35 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NRIP3Q9NQ35 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NRIP3Q9NQ35 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NRIP3Q9NQ35 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NRIP3Q9NQ35 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NRIP3Q9NQ35 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NRIP3Q9NQ35 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NRIP3Q9NQ35 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NRIP3Q9NQ35 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NRIP3Q9NQ35 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NRIP3Q9NQ35 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NRIP3Q9NQ35 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NRIP3Q9NQ35 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NRIP3Q9NQ35 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NRIP3Q9NQ35 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NRIP3Q9NQ35 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NRIP3Q9NQ35 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NRIP3Q9NQ35 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NRIP3Q9NQ35 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NRIP3Q9NQ35 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NRIP3Q9NQ35 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NRIP3Q9NQ35 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NRIP3Q9NQ35 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NRIP3Q9NQ35 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NRIP3Q9NQ35 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NRIP3Q9NQ35 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NRIP3Q9NQ35 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NRIP3Q9NQ35 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NRIP3Q9NQ35 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NRIP3Q9NQ35 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NRIP3Q9NQ35 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NRIP3Q9NQ35 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NRIP3Q9NQ35 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NRIP3Q9NQ35 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NRIP3Q9NQ35 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NRIP3Q9NQ35 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NRIP3Q9NQ35 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NRIP3Q9NQ35 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NRIP3Q9NQ35 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NRIP3Q9NQ35 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NRIP3Q9NQ35 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NRIP3Q9NQ35 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
NRIP3Q9NQ35 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NRIP3Q9NQ35 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NRIP3Q9NQ35 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NRIP3Q9NQ35 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NRIP3Q9NQ35 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NRIP3Q9NQ35 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NRIP3Q9NQ35 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NRIP3Q9NQ35 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NRIP3Q9NQ35 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms