Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ33

ASCL3, Achaete-scute homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL3Q9NQ33 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ASCL3Q9NQ33 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
ASCL3Q9NQ33 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ASCL3Q9NQ33 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ASCL3Q9NQ33 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ASCL3Q9NQ33 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ASCL3Q9NQ33 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ASCL3Q9NQ33 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ASCL3Q9NQ33 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ASCL3Q9NQ33 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ASCL3Q9NQ33 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ASCL3Q9NQ33 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ASCL3Q9NQ33 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ASCL3Q9NQ33 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ASCL3Q9NQ33 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ASCL3Q9NQ33 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ASCL3Q9NQ33 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ASCL3Q9NQ33 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ASCL3Q9NQ33 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ASCL3Q9NQ33 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ASCL3Q9NQ33 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ASCL3Q9NQ33 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ASCL3Q9NQ33 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ASCL3Q9NQ33 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ASCL3Q9NQ33 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ASCL3Q9NQ33 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ASCL3Q9NQ33 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ASCL3Q9NQ33 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
ASCL3Q9NQ33 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ASCL3Q9NQ33 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ASCL3Q9NQ33 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ASCL3Q9NQ33 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ASCL3Q9NQ33 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
ASCL3Q9NQ33 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
ASCL3Q9NQ33 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ASCL3Q9NQ33 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ASCL3Q9NQ33 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ASCL3Q9NQ33 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ASCL3Q9NQ33 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ASCL3Q9NQ33 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ASCL3Q9NQ33 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ASCL3Q9NQ33 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ASCL3Q9NQ33 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ASCL3Q9NQ33 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
ASCL3Q9NQ33 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
ASCL3Q9NQ33 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ASCL3Q9NQ33 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ASCL3Q9NQ33 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ASCL3Q9NQ33 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ASCL3Q9NQ33 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ASCL3Q9NQ33 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ASCL3Q9NQ33 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ASCL3Q9NQ33 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ASCL3Q9NQ33 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ASCL3Q9NQ33 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ASCL3Q9NQ33 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ASCL3Q9NQ33 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ASCL3Q9NQ33 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
ASCL3Q9NQ33 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ASCL3Q9NQ33 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ASCL3Q9NQ33 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ASCL3Q9NQ33 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ASCL3Q9NQ33 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ASCL3Q9NQ33 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ASCL3Q9NQ33 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
ASCL3Q9NQ33 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ASCL3Q9NQ33 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ASCL3Q9NQ33 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ASCL3Q9NQ33 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ASCL3Q9NQ33 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ASCL3Q9NQ33 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ASCL3Q9NQ33 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ASCL3Q9NQ33 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ASCL3Q9NQ33 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ASCL3Q9NQ33 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ASCL3Q9NQ33 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ASCL3Q9NQ33 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ASCL3Q9NQ33 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ASCL3Q9NQ33 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ASCL3Q9NQ33 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ASCL3Q9NQ33 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ASCL3Q9NQ33 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ASCL3Q9NQ33 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ASCL3Q9NQ33 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ASCL3Q9NQ33 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ASCL3Q9NQ33 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
ASCL3Q9NQ33 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
ASCL3Q9NQ33 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ASCL3Q9NQ33 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ASCL3Q9NQ33 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ASCL3Q9NQ33 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
ASCL3Q9NQ33 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ASCL3Q9NQ33 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ASCL3Q9NQ33 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ASCL3Q9NQ33 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ASCL3Q9NQ33 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ASCL3Q9NQ33 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ASCL3Q9NQ33 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ASCL3Q9NQ33 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ASCL3Q9NQ33 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms