Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM2

PLXNA4, Plexin-A4, humanhuman

Predictions only

Length 1,894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNA4Q9HCM2 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PLXNA4Q9HCM2 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PLXNA4Q9HCM2 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PLXNA4Q9HCM2 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PLXNA4Q9HCM2 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PLXNA4Q9HCM2 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PLXNA4Q9HCM2 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PLXNA4Q9HCM2 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PLXNA4Q9HCM2 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PLXNA4Q9HCM2 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PLXNA4Q9HCM2 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PLXNA4Q9HCM2 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PLXNA4Q9HCM2 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PLXNA4Q9HCM2 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PLXNA4Q9HCM2 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PLXNA4Q9HCM2 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PLXNA4Q9HCM2 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PLXNA4Q9HCM2 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PLXNA4Q9HCM2 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PLXNA4Q9HCM2 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PLXNA4Q9HCM2 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PLXNA4Q9HCM2 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PLXNA4Q9HCM2 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PLXNA4Q9HCM2 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PLXNA4Q9HCM2 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PLXNA4Q9HCM2 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PLXNA4Q9HCM2 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PLXNA4Q9HCM2 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PLXNA4Q9HCM2 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PLXNA4Q9HCM2 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PLXNA4Q9HCM2 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PLXNA4Q9HCM2 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PLXNA4Q9HCM2 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PLXNA4Q9HCM2 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PLXNA4Q9HCM2 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PLXNA4Q9HCM2 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PLXNA4Q9HCM2 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PLXNA4Q9HCM2 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PLXNA4Q9HCM2 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PLXNA4Q9HCM2 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PLXNA4Q9HCM2 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PLXNA4Q9HCM2 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PLXNA4Q9HCM2 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PLXNA4Q9HCM2 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PLXNA4Q9HCM2 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PLXNA4Q9HCM2 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PLXNA4Q9HCM2 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PLXNA4Q9HCM2 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PLXNA4Q9HCM2 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PLXNA4Q9HCM2 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PLXNA4Q9HCM2 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PLXNA4Q9HCM2 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PLXNA4Q9HCM2 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PLXNA4Q9HCM2 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PLXNA4Q9HCM2 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PLXNA4Q9HCM2 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PLXNA4Q9HCM2 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PLXNA4Q9HCM2 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PLXNA4Q9HCM2 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PLXNA4Q9HCM2 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PLXNA4Q9HCM2 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PLXNA4Q9HCM2 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PLXNA4Q9HCM2 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PLXNA4Q9HCM2 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PLXNA4Q9HCM2 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PLXNA4Q9HCM2 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PLXNA4Q9HCM2 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PLXNA4Q9HCM2 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PLXNA4Q9HCM2 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PLXNA4Q9HCM2 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PLXNA4Q9HCM2 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PLXNA4Q9HCM2 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PLXNA4Q9HCM2 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PLXNA4Q9HCM2 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PLXNA4Q9HCM2 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PLXNA4Q9HCM2 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PLXNA4Q9HCM2 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PLXNA4Q9HCM2 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PLXNA4Q9HCM2 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PLXNA4Q9HCM2 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PLXNA4Q9HCM2 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PLXNA4Q9HCM2 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PLXNA4Q9HCM2 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PLXNA4Q9HCM2 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PLXNA4Q9HCM2 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PLXNA4Q9HCM2 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PLXNA4Q9HCM2 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PLXNA4Q9HCM2 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PLXNA4Q9HCM2 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PLXNA4Q9HCM2 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PLXNA4Q9HCM2 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PLXNA4Q9HCM2 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PLXNA4Q9HCM2 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PLXNA4Q9HCM2 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PLXNA4Q9HCM2 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PLXNA4Q9HCM2 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PLXNA4Q9HCM2 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PLXNA4Q9HCM2 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PLXNA4Q9HCM2 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PLXNA4Q9HCM2 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms