Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7Z3

NRDE2, Protein NRDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRDE2Q9H7Z3 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NRDE2Q9H7Z3 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NRDE2Q9H7Z3 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NRDE2Q9H7Z3 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NRDE2Q9H7Z3 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NRDE2Q9H7Z3 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NRDE2Q9H7Z3 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NRDE2Q9H7Z3 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NRDE2Q9H7Z3 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NRDE2Q9H7Z3 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NRDE2Q9H7Z3 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NRDE2Q9H7Z3 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NRDE2Q9H7Z3 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NRDE2Q9H7Z3 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NRDE2Q9H7Z3 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NRDE2Q9H7Z3 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NRDE2Q9H7Z3 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NRDE2Q9H7Z3 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NRDE2Q9H7Z3 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NRDE2Q9H7Z3 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NRDE2Q9H7Z3 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NRDE2Q9H7Z3 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NRDE2Q9H7Z3 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NRDE2Q9H7Z3 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NRDE2Q9H7Z3 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NRDE2Q9H7Z3 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NRDE2Q9H7Z3 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NRDE2Q9H7Z3 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NRDE2Q9H7Z3 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NRDE2Q9H7Z3 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NRDE2Q9H7Z3 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NRDE2Q9H7Z3 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NRDE2Q9H7Z3 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NRDE2Q9H7Z3 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NRDE2Q9H7Z3 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NRDE2Q9H7Z3 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NRDE2Q9H7Z3 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NRDE2Q9H7Z3 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NRDE2Q9H7Z3 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NRDE2Q9H7Z3 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NRDE2Q9H7Z3 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NRDE2Q9H7Z3 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NRDE2Q9H7Z3 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NRDE2Q9H7Z3 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NRDE2Q9H7Z3 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NRDE2Q9H7Z3 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NRDE2Q9H7Z3 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NRDE2Q9H7Z3 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NRDE2Q9H7Z3 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NRDE2Q9H7Z3 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NRDE2Q9H7Z3 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NRDE2Q9H7Z3 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NRDE2Q9H7Z3 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NRDE2Q9H7Z3 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NRDE2Q9H7Z3 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NRDE2Q9H7Z3 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NRDE2Q9H7Z3 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NRDE2Q9H7Z3 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NRDE2Q9H7Z3 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NRDE2Q9H7Z3 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NRDE2Q9H7Z3 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NRDE2Q9H7Z3 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NRDE2Q9H7Z3 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NRDE2Q9H7Z3 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NRDE2Q9H7Z3 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NRDE2Q9H7Z3 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NRDE2Q9H7Z3 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NRDE2Q9H7Z3 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NRDE2Q9H7Z3 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NRDE2Q9H7Z3 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NRDE2Q9H7Z3 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NRDE2Q9H7Z3 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NRDE2Q9H7Z3 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NRDE2Q9H7Z3 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NRDE2Q9H7Z3 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NRDE2Q9H7Z3 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NRDE2Q9H7Z3 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NRDE2Q9H7Z3 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NRDE2Q9H7Z3 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NRDE2Q9H7Z3 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NRDE2Q9H7Z3 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NRDE2Q9H7Z3 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NRDE2Q9H7Z3 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NRDE2Q9H7Z3 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NRDE2Q9H7Z3 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NRDE2Q9H7Z3 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NRDE2Q9H7Z3 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NRDE2Q9H7Z3 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NRDE2Q9H7Z3 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NRDE2Q9H7Z3 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NRDE2Q9H7Z3 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NRDE2Q9H7Z3 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NRDE2Q9H7Z3 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NRDE2Q9H7Z3 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NRDE2Q9H7Z3 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NRDE2Q9H7Z3 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NRDE2Q9H7Z3 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NRDE2Q9H7Z3 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NRDE2Q9H7Z3 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NRDE2Q9H7Z3 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms