Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4L4

SENP3, Sentrin-specific protease 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP3Q9H4L4 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.42
SENP3Q9H4L4 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.42
SENP3Q9H4L4 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.42
SENP3Q9H4L4 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.42
SENP3Q9H4L4 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
SENP3Q9H4L4 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
SENP3Q9H4L4 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
SENP3Q9H4L4 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
SENP3Q9H4L4 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
SENP3Q9H4L4 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
SENP3Q9H4L4 AC073115.1-201ENST00000436056 532 ntTSL 4 BASIC30.19■■■□□ 2.42
SENP3Q9H4L4 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC30.19■■■□□ 2.42
SENP3Q9H4L4 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
SENP3Q9H4L4 AL357094.1-201ENST00000603845 844 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
SENP3Q9H4L4 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
SENP3Q9H4L4 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
SENP3Q9H4L4 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
SENP3Q9H4L4 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
SENP3Q9H4L4 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC30.19■■■□□ 2.42
SENP3Q9H4L4 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
SENP3Q9H4L4 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
SENP3Q9H4L4 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
SENP3Q9H4L4 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC30.18■■■□□ 2.42
SENP3Q9H4L4 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
SENP3Q9H4L4 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
SENP3Q9H4L4 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
SENP3Q9H4L4 AL121929.2-201ENST00000609691 1432 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
SENP3Q9H4L4 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
SENP3Q9H4L4 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
SENP3Q9H4L4 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
SENP3Q9H4L4 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
SENP3Q9H4L4 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
SENP3Q9H4L4 LINC01040-201ENST00000425048 666 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
SENP3Q9H4L4 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
SENP3Q9H4L4 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
SENP3Q9H4L4 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
SENP3Q9H4L4 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
SENP3Q9H4L4 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
SENP3Q9H4L4 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
SENP3Q9H4L4 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
SENP3Q9H4L4 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
SENP3Q9H4L4 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
SENP3Q9H4L4 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
SENP3Q9H4L4 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
SENP3Q9H4L4 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
SENP3Q9H4L4 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
SENP3Q9H4L4 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
SENP3Q9H4L4 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
SENP3Q9H4L4 IL20RB-AS1-201ENST00000462176 562 ntTSL 4 BASIC30.16■■■□□ 2.42
SENP3Q9H4L4 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
SENP3Q9H4L4 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
SENP3Q9H4L4 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
SENP3Q9H4L4 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
SENP3Q9H4L4 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
SENP3Q9H4L4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
SENP3Q9H4L4 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
SENP3Q9H4L4 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
SENP3Q9H4L4 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
SENP3Q9H4L4 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
SENP3Q9H4L4 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
SENP3Q9H4L4 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
SENP3Q9H4L4 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
SENP3Q9H4L4 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
SENP3Q9H4L4 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
SENP3Q9H4L4 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
SENP3Q9H4L4 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
SENP3Q9H4L4 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
SENP3Q9H4L4 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
SENP3Q9H4L4 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
SENP3Q9H4L4 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
SENP3Q9H4L4 PTP4A2-201ENST00000457805 1032 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
SENP3Q9H4L4 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC30.14■■■□□ 2.42
SENP3Q9H4L4 LINC00907-210ENST00000593316 847 ntTSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.42
SENP3Q9H4L4 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
SENP3Q9H4L4 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
SENP3Q9H4L4 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
SENP3Q9H4L4 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
SENP3Q9H4L4 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
SENP3Q9H4L4 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
SENP3Q9H4L4 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
SENP3Q9H4L4 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
SENP3Q9H4L4 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
SENP3Q9H4L4 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
SENP3Q9H4L4 AC087273.1-201ENST00000519368 529 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
SENP3Q9H4L4 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
SENP3Q9H4L4 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC30.13■■■□□ 2.41
SENP3Q9H4L4 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
SENP3Q9H4L4 STARD13-AS-208ENST00000589472 859 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
SENP3Q9H4L4 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
SENP3Q9H4L4 CU638689.4-208ENST00000623324 936 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
SENP3Q9H4L4 CU634019.6-203ENST00000624728 936 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
SENP3Q9H4L4 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
SENP3Q9H4L4 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
SENP3Q9H4L4 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
SENP3Q9H4L4 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
SENP3Q9H4L4 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
SENP3Q9H4L4 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
SENP3Q9H4L4 STATH-201ENST00000246895 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
SENP3Q9H4L4 C17orf58-202ENST00000449250 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
SENP3Q9H4L4 AC025423.2-201ENST00000537570 439 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms