Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ7

GFRA4, GDNF family receptor alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA4Q9GZZ7 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GFRA4Q9GZZ7 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GFRA4Q9GZZ7 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GFRA4Q9GZZ7 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GFRA4Q9GZZ7 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GFRA4Q9GZZ7 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GFRA4Q9GZZ7 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GFRA4Q9GZZ7 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GFRA4Q9GZZ7 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GFRA4Q9GZZ7 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GFRA4Q9GZZ7 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GFRA4Q9GZZ7 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GFRA4Q9GZZ7 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GFRA4Q9GZZ7 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GFRA4Q9GZZ7 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GFRA4Q9GZZ7 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GFRA4Q9GZZ7 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GFRA4Q9GZZ7 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GFRA4Q9GZZ7 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GFRA4Q9GZZ7 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GFRA4Q9GZZ7 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GFRA4Q9GZZ7 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GFRA4Q9GZZ7 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GFRA4Q9GZZ7 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GFRA4Q9GZZ7 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GFRA4Q9GZZ7 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GFRA4Q9GZZ7 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GFRA4Q9GZZ7 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GFRA4Q9GZZ7 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GFRA4Q9GZZ7 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GFRA4Q9GZZ7 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GFRA4Q9GZZ7 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GFRA4Q9GZZ7 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GFRA4Q9GZZ7 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GFRA4Q9GZZ7 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GFRA4Q9GZZ7 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GFRA4Q9GZZ7 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GFRA4Q9GZZ7 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GFRA4Q9GZZ7 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GFRA4Q9GZZ7 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GFRA4Q9GZZ7 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GFRA4Q9GZZ7 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GFRA4Q9GZZ7 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GFRA4Q9GZZ7 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GFRA4Q9GZZ7 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GFRA4Q9GZZ7 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GFRA4Q9GZZ7 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GFRA4Q9GZZ7 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GFRA4Q9GZZ7 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GFRA4Q9GZZ7 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GFRA4Q9GZZ7 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GFRA4Q9GZZ7 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GFRA4Q9GZZ7 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GFRA4Q9GZZ7 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GFRA4Q9GZZ7 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GFRA4Q9GZZ7 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GFRA4Q9GZZ7 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GFRA4Q9GZZ7 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GFRA4Q9GZZ7 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GFRA4Q9GZZ7 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GFRA4Q9GZZ7 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GFRA4Q9GZZ7 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GFRA4Q9GZZ7 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GFRA4Q9GZZ7 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GFRA4Q9GZZ7 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GFRA4Q9GZZ7 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GFRA4Q9GZZ7 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GFRA4Q9GZZ7 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GFRA4Q9GZZ7 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GFRA4Q9GZZ7 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GFRA4Q9GZZ7 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GFRA4Q9GZZ7 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GFRA4Q9GZZ7 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GFRA4Q9GZZ7 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GFRA4Q9GZZ7 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GFRA4Q9GZZ7 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GFRA4Q9GZZ7 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GFRA4Q9GZZ7 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GFRA4Q9GZZ7 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GFRA4Q9GZZ7 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GFRA4Q9GZZ7 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GFRA4Q9GZZ7 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GFRA4Q9GZZ7 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GFRA4Q9GZZ7 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GFRA4Q9GZZ7 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GFRA4Q9GZZ7 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GFRA4Q9GZZ7 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GFRA4Q9GZZ7 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GFRA4Q9GZZ7 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GFRA4Q9GZZ7 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GFRA4Q9GZZ7 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GFRA4Q9GZZ7 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GFRA4Q9GZZ7 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GFRA4Q9GZZ7 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GFRA4Q9GZZ7 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GFRA4Q9GZZ7 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GFRA4Q9GZZ7 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GFRA4Q9GZZ7 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GFRA4Q9GZZ7 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GFRA4Q9GZZ7 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms