Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZR1

SENP6, Sentrin-specific protease 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP6Q9GZR1 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SENP6Q9GZR1 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SENP6Q9GZR1 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SENP6Q9GZR1 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SENP6Q9GZR1 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SENP6Q9GZR1 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SENP6Q9GZR1 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SENP6Q9GZR1 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SENP6Q9GZR1 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SENP6Q9GZR1 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SENP6Q9GZR1 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SENP6Q9GZR1 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SENP6Q9GZR1 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SENP6Q9GZR1 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SENP6Q9GZR1 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SENP6Q9GZR1 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SENP6Q9GZR1 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SENP6Q9GZR1 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SENP6Q9GZR1 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SENP6Q9GZR1 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SENP6Q9GZR1 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SENP6Q9GZR1 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SENP6Q9GZR1 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SENP6Q9GZR1 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SENP6Q9GZR1 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SENP6Q9GZR1 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SENP6Q9GZR1 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SENP6Q9GZR1 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SENP6Q9GZR1 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SENP6Q9GZR1 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SENP6Q9GZR1 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SENP6Q9GZR1 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SENP6Q9GZR1 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SENP6Q9GZR1 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SENP6Q9GZR1 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SENP6Q9GZR1 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SENP6Q9GZR1 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SENP6Q9GZR1 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SENP6Q9GZR1 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SENP6Q9GZR1 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SENP6Q9GZR1 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SENP6Q9GZR1 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SENP6Q9GZR1 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SENP6Q9GZR1 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SENP6Q9GZR1 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SENP6Q9GZR1 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SENP6Q9GZR1 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SENP6Q9GZR1 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SENP6Q9GZR1 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SENP6Q9GZR1 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SENP6Q9GZR1 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SENP6Q9GZR1 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SENP6Q9GZR1 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SENP6Q9GZR1 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SENP6Q9GZR1 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SENP6Q9GZR1 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SENP6Q9GZR1 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SENP6Q9GZR1 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SENP6Q9GZR1 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SENP6Q9GZR1 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SENP6Q9GZR1 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SENP6Q9GZR1 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SENP6Q9GZR1 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SENP6Q9GZR1 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SENP6Q9GZR1 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SENP6Q9GZR1 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SENP6Q9GZR1 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SENP6Q9GZR1 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SENP6Q9GZR1 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SENP6Q9GZR1 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SENP6Q9GZR1 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SENP6Q9GZR1 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SENP6Q9GZR1 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SENP6Q9GZR1 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SENP6Q9GZR1 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SENP6Q9GZR1 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SENP6Q9GZR1 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SENP6Q9GZR1 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SENP6Q9GZR1 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SENP6Q9GZR1 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SENP6Q9GZR1 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SENP6Q9GZR1 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SENP6Q9GZR1 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SENP6Q9GZR1 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SENP6Q9GZR1 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SENP6Q9GZR1 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SENP6Q9GZR1 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SENP6Q9GZR1 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SENP6Q9GZR1 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SENP6Q9GZR1 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SENP6Q9GZR1 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SENP6Q9GZR1 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SENP6Q9GZR1 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SENP6Q9GZR1 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SENP6Q9GZR1 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SENP6Q9GZR1 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SENP6Q9GZR1 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SENP6Q9GZR1 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SENP6Q9GZR1 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SENP6Q9GZR1 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms