Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY12

SCAPER, S phase cyclin A-associated protein in the endoplasmic reticulum, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPERQ9BY12 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
SCAPERQ9BY12 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
SCAPERQ9BY12 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
SCAPERQ9BY12 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
SCAPERQ9BY12 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
SCAPERQ9BY12 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
SCAPERQ9BY12 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC31.42■■■□□ 2.62
SCAPERQ9BY12 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC31.42■■■□□ 2.62
SCAPERQ9BY12 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC31.42■■■□□ 2.62
SCAPERQ9BY12 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
SCAPERQ9BY12 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC31.42■■■□□ 2.62
SCAPERQ9BY12 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
SCAPERQ9BY12 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
SCAPERQ9BY12 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC31.42■■■□□ 2.62
SCAPERQ9BY12 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
SCAPERQ9BY12 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
SCAPERQ9BY12 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
SCAPERQ9BY12 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
SCAPERQ9BY12 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
SCAPERQ9BY12 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
SCAPERQ9BY12 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
SCAPERQ9BY12 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
SCAPERQ9BY12 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
SCAPERQ9BY12 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
SCAPERQ9BY12 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC31.41■■■□□ 2.62
SCAPERQ9BY12 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
SCAPERQ9BY12 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
SCAPERQ9BY12 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.41■■■□□ 2.62
SCAPERQ9BY12 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
SCAPERQ9BY12 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
SCAPERQ9BY12 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
SCAPERQ9BY12 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
SCAPERQ9BY12 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
SCAPERQ9BY12 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC31.41■■■□□ 2.62
SCAPERQ9BY12 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
SCAPERQ9BY12 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
SCAPERQ9BY12 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.41■■■□□ 2.62
SCAPERQ9BY12 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC31.41■■■□□ 2.62
SCAPERQ9BY12 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
SCAPERQ9BY12 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
SCAPERQ9BY12 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC31.41■■■□□ 2.62
SCAPERQ9BY12 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
SCAPERQ9BY12 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
SCAPERQ9BY12 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC31.41■■■□□ 2.62
SCAPERQ9BY12 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
SCAPERQ9BY12 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
SCAPERQ9BY12 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
SCAPERQ9BY12 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
SCAPERQ9BY12 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
SCAPERQ9BY12 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
SCAPERQ9BY12 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
SCAPERQ9BY12 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
SCAPERQ9BY12 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
SCAPERQ9BY12 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
SCAPERQ9BY12 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC31.4■■■□□ 2.62
SCAPERQ9BY12 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.4■■■□□ 2.62
SCAPERQ9BY12 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC31.4■■■□□ 2.62
SCAPERQ9BY12 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
SCAPERQ9BY12 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC31.4■■■□□ 2.62
SCAPERQ9BY12 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
SCAPERQ9BY12 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
SCAPERQ9BY12 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
SCAPERQ9BY12 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC31.39■■■□□ 2.62
SCAPERQ9BY12 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
SCAPERQ9BY12 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
SCAPERQ9BY12 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
SCAPERQ9BY12 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC31.39■■■□□ 2.62
SCAPERQ9BY12 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
SCAPERQ9BY12 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
SCAPERQ9BY12 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.61
SCAPERQ9BY12 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
SCAPERQ9BY12 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
SCAPERQ9BY12 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC31.38■■■□□ 2.61
SCAPERQ9BY12 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
SCAPERQ9BY12 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
SCAPERQ9BY12 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
SCAPERQ9BY12 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC31.38■■■□□ 2.61
SCAPERQ9BY12 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC31.38■■■□□ 2.61
SCAPERQ9BY12 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC31.38■■■□□ 2.61
SCAPERQ9BY12 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC31.38■■■□□ 2.61
SCAPERQ9BY12 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
SCAPERQ9BY12 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
SCAPERQ9BY12 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
SCAPERQ9BY12 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
SCAPERQ9BY12 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
SCAPERQ9BY12 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC31.37■■■□□ 2.61
SCAPERQ9BY12 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
SCAPERQ9BY12 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
SCAPERQ9BY12 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
SCAPERQ9BY12 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
SCAPERQ9BY12 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
SCAPERQ9BY12 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
SCAPERQ9BY12 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
SCAPERQ9BY12 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
SCAPERQ9BY12 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
SCAPERQ9BY12 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
SCAPERQ9BY12 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
SCAPERQ9BY12 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
SCAPERQ9BY12 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC31.36■■■□□ 2.61
SCAPERQ9BY12 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms