Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
RNF17Q9BXT8 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
RNF17Q9BXT8 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
RNF17Q9BXT8 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
RNF17Q9BXT8 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
RNF17Q9BXT8 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
RNF17Q9BXT8 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC30.58■■■□□ 2.49
RNF17Q9BXT8 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
RNF17Q9BXT8 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
RNF17Q9BXT8 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
RNF17Q9BXT8 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
RNF17Q9BXT8 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC30.57■■■□□ 2.48
RNF17Q9BXT8 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
RNF17Q9BXT8 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
RNF17Q9BXT8 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
RNF17Q9BXT8 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
RNF17Q9BXT8 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
RNF17Q9BXT8 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
RNF17Q9BXT8 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
RNF17Q9BXT8 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
RNF17Q9BXT8 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
RNF17Q9BXT8 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
RNF17Q9BXT8 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
RNF17Q9BXT8 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
RNF17Q9BXT8 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
RNF17Q9BXT8 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
RNF17Q9BXT8 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
RNF17Q9BXT8 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
RNF17Q9BXT8 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
RNF17Q9BXT8 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
RNF17Q9BXT8 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
RNF17Q9BXT8 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
RNF17Q9BXT8 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
RNF17Q9BXT8 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
RNF17Q9BXT8 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC30.55■■■□□ 2.48
RNF17Q9BXT8 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
RNF17Q9BXT8 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
RNF17Q9BXT8 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
RNF17Q9BXT8 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
RNF17Q9BXT8 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
RNF17Q9BXT8 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
RNF17Q9BXT8 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
RNF17Q9BXT8 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC30.54■■■□□ 2.48
RNF17Q9BXT8 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
RNF17Q9BXT8 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
RNF17Q9BXT8 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
RNF17Q9BXT8 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC30.54■■■□□ 2.48
RNF17Q9BXT8 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
RNF17Q9BXT8 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
RNF17Q9BXT8 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
RNF17Q9BXT8 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
RNF17Q9BXT8 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
RNF17Q9BXT8 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
RNF17Q9BXT8 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
RNF17Q9BXT8 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
RNF17Q9BXT8 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
RNF17Q9BXT8 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
RNF17Q9BXT8 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
RNF17Q9BXT8 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC30.53■■■□□ 2.48
RNF17Q9BXT8 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
RNF17Q9BXT8 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
RNF17Q9BXT8 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
RNF17Q9BXT8 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
RNF17Q9BXT8 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
RNF17Q9BXT8 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
RNF17Q9BXT8 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
RNF17Q9BXT8 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
RNF17Q9BXT8 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
RNF17Q9BXT8 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
RNF17Q9BXT8 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
RNF17Q9BXT8 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
RNF17Q9BXT8 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
RNF17Q9BXT8 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
RNF17Q9BXT8 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
RNF17Q9BXT8 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
RNF17Q9BXT8 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
RNF17Q9BXT8 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
RNF17Q9BXT8 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.48
RNF17Q9BXT8 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
RNF17Q9BXT8 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.48
RNF17Q9BXT8 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.48
RNF17Q9BXT8 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
RNF17Q9BXT8 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
RNF17Q9BXT8 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
RNF17Q9BXT8 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
RNF17Q9BXT8 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
RNF17Q9BXT8 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.48
RNF17Q9BXT8 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
RNF17Q9BXT8 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
RNF17Q9BXT8 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
RNF17Q9BXT8 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
RNF17Q9BXT8 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
RNF17Q9BXT8 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC30.51■■■□□ 2.47
RNF17Q9BXT8 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
RNF17Q9BXT8 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
RNF17Q9BXT8 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
RNF17Q9BXT8 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
RNF17Q9BXT8 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
RNF17Q9BXT8 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
RNF17Q9BXT8 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms