Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXL7

CARD11, Caspase recruitment domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARD11Q9BXL7 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CARD11Q9BXL7 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CARD11Q9BXL7 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
CARD11Q9BXL7 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CARD11Q9BXL7 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CARD11Q9BXL7 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CARD11Q9BXL7 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CARD11Q9BXL7 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CARD11Q9BXL7 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CARD11Q9BXL7 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CARD11Q9BXL7 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CARD11Q9BXL7 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CARD11Q9BXL7 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CARD11Q9BXL7 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CARD11Q9BXL7 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CARD11Q9BXL7 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
CARD11Q9BXL7 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CARD11Q9BXL7 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CARD11Q9BXL7 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CARD11Q9BXL7 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CARD11Q9BXL7 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
CARD11Q9BXL7 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CARD11Q9BXL7 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CARD11Q9BXL7 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CARD11Q9BXL7 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
CARD11Q9BXL7 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CARD11Q9BXL7 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CARD11Q9BXL7 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CARD11Q9BXL7 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CARD11Q9BXL7 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CARD11Q9BXL7 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CARD11Q9BXL7 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CARD11Q9BXL7 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CARD11Q9BXL7 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CARD11Q9BXL7 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CARD11Q9BXL7 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CARD11Q9BXL7 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CARD11Q9BXL7 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CARD11Q9BXL7 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CARD11Q9BXL7 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CARD11Q9BXL7 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CARD11Q9BXL7 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CARD11Q9BXL7 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CARD11Q9BXL7 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CARD11Q9BXL7 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CARD11Q9BXL7 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CARD11Q9BXL7 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CARD11Q9BXL7 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CARD11Q9BXL7 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CARD11Q9BXL7 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CARD11Q9BXL7 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CARD11Q9BXL7 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
CARD11Q9BXL7 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CARD11Q9BXL7 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CARD11Q9BXL7 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CARD11Q9BXL7 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CARD11Q9BXL7 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CARD11Q9BXL7 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CARD11Q9BXL7 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CARD11Q9BXL7 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CARD11Q9BXL7 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CARD11Q9BXL7 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CARD11Q9BXL7 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CARD11Q9BXL7 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
CARD11Q9BXL7 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CARD11Q9BXL7 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CARD11Q9BXL7 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CARD11Q9BXL7 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CARD11Q9BXL7 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CARD11Q9BXL7 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CARD11Q9BXL7 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CARD11Q9BXL7 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CARD11Q9BXL7 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CARD11Q9BXL7 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CARD11Q9BXL7 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CARD11Q9BXL7 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CARD11Q9BXL7 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CARD11Q9BXL7 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CARD11Q9BXL7 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CARD11Q9BXL7 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CARD11Q9BXL7 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
CARD11Q9BXL7 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CARD11Q9BXL7 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CARD11Q9BXL7 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CARD11Q9BXL7 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CARD11Q9BXL7 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CARD11Q9BXL7 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
CARD11Q9BXL7 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
CARD11Q9BXL7 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
CARD11Q9BXL7 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
CARD11Q9BXL7 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
CARD11Q9BXL7 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CARD11Q9BXL7 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CARD11Q9BXL7 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CARD11Q9BXL7 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CARD11Q9BXL7 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CARD11Q9BXL7 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CARD11Q9BXL7 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CARD11Q9BXL7 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CARD11Q9BXL7 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms