Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX97

PLVAP, Plasmalemma vesicle-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLVAPQ9BX97 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PLVAPQ9BX97 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PLVAPQ9BX97 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PLVAPQ9BX97 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PLVAPQ9BX97 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PLVAPQ9BX97 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PLVAPQ9BX97 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PLVAPQ9BX97 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PLVAPQ9BX97 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PLVAPQ9BX97 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PLVAPQ9BX97 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PLVAPQ9BX97 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PLVAPQ9BX97 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PLVAPQ9BX97 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PLVAPQ9BX97 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PLVAPQ9BX97 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PLVAPQ9BX97 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PLVAPQ9BX97 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PLVAPQ9BX97 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PLVAPQ9BX97 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PLVAPQ9BX97 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PLVAPQ9BX97 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PLVAPQ9BX97 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PLVAPQ9BX97 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PLVAPQ9BX97 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PLVAPQ9BX97 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PLVAPQ9BX97 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PLVAPQ9BX97 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PLVAPQ9BX97 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PLVAPQ9BX97 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PLVAPQ9BX97 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PLVAPQ9BX97 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PLVAPQ9BX97 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PLVAPQ9BX97 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PLVAPQ9BX97 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PLVAPQ9BX97 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PLVAPQ9BX97 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PLVAPQ9BX97 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PLVAPQ9BX97 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PLVAPQ9BX97 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PLVAPQ9BX97 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PLVAPQ9BX97 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PLVAPQ9BX97 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PLVAPQ9BX97 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PLVAPQ9BX97 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PLVAPQ9BX97 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PLVAPQ9BX97 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PLVAPQ9BX97 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PLVAPQ9BX97 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PLVAPQ9BX97 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PLVAPQ9BX97 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PLVAPQ9BX97 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PLVAPQ9BX97 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PLVAPQ9BX97 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PLVAPQ9BX97 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PLVAPQ9BX97 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PLVAPQ9BX97 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
PLVAPQ9BX97 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
PLVAPQ9BX97 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PLVAPQ9BX97 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PLVAPQ9BX97 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PLVAPQ9BX97 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PLVAPQ9BX97 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PLVAPQ9BX97 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PLVAPQ9BX97 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PLVAPQ9BX97 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PLVAPQ9BX97 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PLVAPQ9BX97 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PLVAPQ9BX97 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PLVAPQ9BX97 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PLVAPQ9BX97 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PLVAPQ9BX97 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PLVAPQ9BX97 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PLVAPQ9BX97 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PLVAPQ9BX97 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PLVAPQ9BX97 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PLVAPQ9BX97 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PLVAPQ9BX97 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PLVAPQ9BX97 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PLVAPQ9BX97 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PLVAPQ9BX97 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PLVAPQ9BX97 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PLVAPQ9BX97 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PLVAPQ9BX97 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PLVAPQ9BX97 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PLVAPQ9BX97 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PLVAPQ9BX97 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PLVAPQ9BX97 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PLVAPQ9BX97 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PLVAPQ9BX97 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PLVAPQ9BX97 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PLVAPQ9BX97 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PLVAPQ9BX97 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PLVAPQ9BX97 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PLVAPQ9BX97 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PLVAPQ9BX97 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PLVAPQ9BX97 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PLVAPQ9BX97 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PLVAPQ9BX97 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PLVAPQ9BX97 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms