Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU61

NDUFAF3, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFAF3Q9BU61 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NDUFAF3Q9BU61 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NDUFAF3Q9BU61 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NDUFAF3Q9BU61 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NDUFAF3Q9BU61 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NDUFAF3Q9BU61 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NDUFAF3Q9BU61 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NDUFAF3Q9BU61 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NDUFAF3Q9BU61 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NDUFAF3Q9BU61 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NDUFAF3Q9BU61 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NDUFAF3Q9BU61 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NDUFAF3Q9BU61 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NDUFAF3Q9BU61 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NDUFAF3Q9BU61 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NDUFAF3Q9BU61 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NDUFAF3Q9BU61 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NDUFAF3Q9BU61 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NDUFAF3Q9BU61 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NDUFAF3Q9BU61 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NDUFAF3Q9BU61 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NDUFAF3Q9BU61 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NDUFAF3Q9BU61 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NDUFAF3Q9BU61 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NDUFAF3Q9BU61 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NDUFAF3Q9BU61 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NDUFAF3Q9BU61 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NDUFAF3Q9BU61 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NDUFAF3Q9BU61 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NDUFAF3Q9BU61 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NDUFAF3Q9BU61 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NDUFAF3Q9BU61 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NDUFAF3Q9BU61 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NDUFAF3Q9BU61 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NDUFAF3Q9BU61 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NDUFAF3Q9BU61 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NDUFAF3Q9BU61 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NDUFAF3Q9BU61 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NDUFAF3Q9BU61 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NDUFAF3Q9BU61 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NDUFAF3Q9BU61 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NDUFAF3Q9BU61 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NDUFAF3Q9BU61 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NDUFAF3Q9BU61 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NDUFAF3Q9BU61 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NDUFAF3Q9BU61 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NDUFAF3Q9BU61 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NDUFAF3Q9BU61 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NDUFAF3Q9BU61 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NDUFAF3Q9BU61 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NDUFAF3Q9BU61 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NDUFAF3Q9BU61 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NDUFAF3Q9BU61 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NDUFAF3Q9BU61 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NDUFAF3Q9BU61 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NDUFAF3Q9BU61 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NDUFAF3Q9BU61 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NDUFAF3Q9BU61 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NDUFAF3Q9BU61 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NDUFAF3Q9BU61 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NDUFAF3Q9BU61 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NDUFAF3Q9BU61 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NDUFAF3Q9BU61 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NDUFAF3Q9BU61 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NDUFAF3Q9BU61 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NDUFAF3Q9BU61 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NDUFAF3Q9BU61 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
NDUFAF3Q9BU61 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NDUFAF3Q9BU61 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NDUFAF3Q9BU61 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NDUFAF3Q9BU61 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
NDUFAF3Q9BU61 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NDUFAF3Q9BU61 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NDUFAF3Q9BU61 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NDUFAF3Q9BU61 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NDUFAF3Q9BU61 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NDUFAF3Q9BU61 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NDUFAF3Q9BU61 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NDUFAF3Q9BU61 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NDUFAF3Q9BU61 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NDUFAF3Q9BU61 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NDUFAF3Q9BU61 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NDUFAF3Q9BU61 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NDUFAF3Q9BU61 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NDUFAF3Q9BU61 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NDUFAF3Q9BU61 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
NDUFAF3Q9BU61 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NDUFAF3Q9BU61 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NDUFAF3Q9BU61 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NDUFAF3Q9BU61 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NDUFAF3Q9BU61 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NDUFAF3Q9BU61 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NDUFAF3Q9BU61 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NDUFAF3Q9BU61 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NDUFAF3Q9BU61 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NDUFAF3Q9BU61 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NDUFAF3Q9BU61 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NDUFAF3Q9BU61 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NDUFAF3Q9BU61 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NDUFAF3Q9BU61 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms