Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE4

HERPUD2, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD2Q9BSE4 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
HERPUD2Q9BSE4 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HERPUD2Q9BSE4 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HERPUD2Q9BSE4 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HERPUD2Q9BSE4 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HERPUD2Q9BSE4 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HERPUD2Q9BSE4 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HERPUD2Q9BSE4 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HERPUD2Q9BSE4 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HERPUD2Q9BSE4 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HERPUD2Q9BSE4 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HERPUD2Q9BSE4 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HERPUD2Q9BSE4 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HERPUD2Q9BSE4 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HERPUD2Q9BSE4 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HERPUD2Q9BSE4 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HERPUD2Q9BSE4 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HERPUD2Q9BSE4 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HERPUD2Q9BSE4 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HERPUD2Q9BSE4 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HERPUD2Q9BSE4 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HERPUD2Q9BSE4 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HERPUD2Q9BSE4 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HERPUD2Q9BSE4 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HERPUD2Q9BSE4 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HERPUD2Q9BSE4 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HERPUD2Q9BSE4 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HERPUD2Q9BSE4 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HERPUD2Q9BSE4 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HERPUD2Q9BSE4 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
HERPUD2Q9BSE4 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HERPUD2Q9BSE4 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HERPUD2Q9BSE4 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HERPUD2Q9BSE4 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
HERPUD2Q9BSE4 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HERPUD2Q9BSE4 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HERPUD2Q9BSE4 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HERPUD2Q9BSE4 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HERPUD2Q9BSE4 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HERPUD2Q9BSE4 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HERPUD2Q9BSE4 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HERPUD2Q9BSE4 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HERPUD2Q9BSE4 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HERPUD2Q9BSE4 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HERPUD2Q9BSE4 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HERPUD2Q9BSE4 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
HERPUD2Q9BSE4 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HERPUD2Q9BSE4 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HERPUD2Q9BSE4 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HERPUD2Q9BSE4 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HERPUD2Q9BSE4 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HERPUD2Q9BSE4 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HERPUD2Q9BSE4 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HERPUD2Q9BSE4 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HERPUD2Q9BSE4 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HERPUD2Q9BSE4 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HERPUD2Q9BSE4 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HERPUD2Q9BSE4 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HERPUD2Q9BSE4 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HERPUD2Q9BSE4 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HERPUD2Q9BSE4 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HERPUD2Q9BSE4 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HERPUD2Q9BSE4 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HERPUD2Q9BSE4 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HERPUD2Q9BSE4 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HERPUD2Q9BSE4 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HERPUD2Q9BSE4 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
HERPUD2Q9BSE4 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HERPUD2Q9BSE4 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HERPUD2Q9BSE4 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HERPUD2Q9BSE4 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HERPUD2Q9BSE4 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HERPUD2Q9BSE4 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HERPUD2Q9BSE4 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HERPUD2Q9BSE4 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HERPUD2Q9BSE4 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HERPUD2Q9BSE4 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HERPUD2Q9BSE4 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HERPUD2Q9BSE4 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HERPUD2Q9BSE4 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
HERPUD2Q9BSE4 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
HERPUD2Q9BSE4 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HERPUD2Q9BSE4 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HERPUD2Q9BSE4 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
HERPUD2Q9BSE4 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HERPUD2Q9BSE4 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HERPUD2Q9BSE4 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HERPUD2Q9BSE4 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HERPUD2Q9BSE4 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HERPUD2Q9BSE4 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HERPUD2Q9BSE4 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HERPUD2Q9BSE4 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HERPUD2Q9BSE4 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HERPUD2Q9BSE4 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HERPUD2Q9BSE4 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HERPUD2Q9BSE4 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HERPUD2Q9BSE4 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HERPUD2Q9BSE4 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HERPUD2Q9BSE4 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
HERPUD2Q9BSE4 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms