Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQK8

LPIN3, Phosphatidate phosphatase LPIN3, humanhuman

Predictions only

Length 851 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPIN3Q9BQK8 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LPIN3Q9BQK8 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LPIN3Q9BQK8 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LPIN3Q9BQK8 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LPIN3Q9BQK8 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LPIN3Q9BQK8 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LPIN3Q9BQK8 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LPIN3Q9BQK8 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LPIN3Q9BQK8 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LPIN3Q9BQK8 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LPIN3Q9BQK8 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
LPIN3Q9BQK8 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
LPIN3Q9BQK8 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
LPIN3Q9BQK8 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LPIN3Q9BQK8 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LPIN3Q9BQK8 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LPIN3Q9BQK8 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LPIN3Q9BQK8 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LPIN3Q9BQK8 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LPIN3Q9BQK8 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LPIN3Q9BQK8 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LPIN3Q9BQK8 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LPIN3Q9BQK8 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LPIN3Q9BQK8 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LPIN3Q9BQK8 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LPIN3Q9BQK8 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LPIN3Q9BQK8 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LPIN3Q9BQK8 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LPIN3Q9BQK8 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LPIN3Q9BQK8 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LPIN3Q9BQK8 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
LPIN3Q9BQK8 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22■■□□□ 1.11
LPIN3Q9BQK8 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22■■□□□ 1.11
LPIN3Q9BQK8 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22■■□□□ 1.11
LPIN3Q9BQK8 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LPIN3Q9BQK8 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
LPIN3Q9BQK8 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LPIN3Q9BQK8 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LPIN3Q9BQK8 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LPIN3Q9BQK8 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LPIN3Q9BQK8 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
LPIN3Q9BQK8 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22■■□□□ 1.11
LPIN3Q9BQK8 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
LPIN3Q9BQK8 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LPIN3Q9BQK8 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LPIN3Q9BQK8 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LPIN3Q9BQK8 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LPIN3Q9BQK8 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LPIN3Q9BQK8 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LPIN3Q9BQK8 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LPIN3Q9BQK8 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LPIN3Q9BQK8 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
LPIN3Q9BQK8 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
LPIN3Q9BQK8 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LPIN3Q9BQK8 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LPIN3Q9BQK8 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
LPIN3Q9BQK8 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LPIN3Q9BQK8 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LPIN3Q9BQK8 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LPIN3Q9BQK8 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LPIN3Q9BQK8 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LPIN3Q9BQK8 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LPIN3Q9BQK8 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LPIN3Q9BQK8 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LPIN3Q9BQK8 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LPIN3Q9BQK8 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LPIN3Q9BQK8 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LPIN3Q9BQK8 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LPIN3Q9BQK8 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LPIN3Q9BQK8 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LPIN3Q9BQK8 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
LPIN3Q9BQK8 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
LPIN3Q9BQK8 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LPIN3Q9BQK8 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
LPIN3Q9BQK8 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LPIN3Q9BQK8 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LPIN3Q9BQK8 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LPIN3Q9BQK8 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LPIN3Q9BQK8 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LPIN3Q9BQK8 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LPIN3Q9BQK8 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
LPIN3Q9BQK8 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LPIN3Q9BQK8 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LPIN3Q9BQK8 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LPIN3Q9BQK8 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LPIN3Q9BQK8 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LPIN3Q9BQK8 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LPIN3Q9BQK8 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LPIN3Q9BQK8 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LPIN3Q9BQK8 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
LPIN3Q9BQK8 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LPIN3Q9BQK8 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
LPIN3Q9BQK8 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LPIN3Q9BQK8 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LPIN3Q9BQK8 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LPIN3Q9BQK8 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LPIN3Q9BQK8 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LPIN3Q9BQK8 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LPIN3Q9BQK8 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LPIN3Q9BQK8 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms