Protein–RNA interactions for Protein: Q99590

SCAF11, Protein SCAF11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF11Q99590 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
SCAF11Q99590 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SCAF11Q99590 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SCAF11Q99590 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SCAF11Q99590 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SCAF11Q99590 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SCAF11Q99590 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SCAF11Q99590 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SCAF11Q99590 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SCAF11Q99590 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
SCAF11Q99590 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SCAF11Q99590 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
SCAF11Q99590 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
SCAF11Q99590 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
SCAF11Q99590 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SCAF11Q99590 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SCAF11Q99590 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
SCAF11Q99590 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
SCAF11Q99590 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SCAF11Q99590 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SCAF11Q99590 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
SCAF11Q99590 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
SCAF11Q99590 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
SCAF11Q99590 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
SCAF11Q99590 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
SCAF11Q99590 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
SCAF11Q99590 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
SCAF11Q99590 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SCAF11Q99590 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
SCAF11Q99590 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
SCAF11Q99590 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SCAF11Q99590 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
SCAF11Q99590 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
SCAF11Q99590 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
SCAF11Q99590 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
SCAF11Q99590 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
SCAF11Q99590 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
SCAF11Q99590 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
SCAF11Q99590 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
SCAF11Q99590 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC29.91■■■□□ 2.38
SCAF11Q99590 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
SCAF11Q99590 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
SCAF11Q99590 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
SCAF11Q99590 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SCAF11Q99590 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SCAF11Q99590 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SCAF11Q99590 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
SCAF11Q99590 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SCAF11Q99590 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SCAF11Q99590 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC29.9■■■□□ 2.38
SCAF11Q99590 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SCAF11Q99590 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
SCAF11Q99590 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SCAF11Q99590 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SCAF11Q99590 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
SCAF11Q99590 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
SCAF11Q99590 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
SCAF11Q99590 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
SCAF11Q99590 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
SCAF11Q99590 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
SCAF11Q99590 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
SCAF11Q99590 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
SCAF11Q99590 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
SCAF11Q99590 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
SCAF11Q99590 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
SCAF11Q99590 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
SCAF11Q99590 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
SCAF11Q99590 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SCAF11Q99590 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SCAF11Q99590 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
SCAF11Q99590 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
SCAF11Q99590 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
SCAF11Q99590 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
SCAF11Q99590 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SCAF11Q99590 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SCAF11Q99590 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SCAF11Q99590 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SCAF11Q99590 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
SCAF11Q99590 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
SCAF11Q99590 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SCAF11Q99590 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SCAF11Q99590 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SCAF11Q99590 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
SCAF11Q99590 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SCAF11Q99590 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SCAF11Q99590 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SCAF11Q99590 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SCAF11Q99590 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SCAF11Q99590 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SCAF11Q99590 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SCAF11Q99590 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SCAF11Q99590 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SCAF11Q99590 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SCAF11Q99590 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SCAF11Q99590 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SCAF11Q99590 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SCAF11Q99590 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SCAF11Q99590 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SCAF11Q99590 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SCAF11Q99590 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms