Protein–RNA interactions for Protein: Q96QS3

ARX, Homeobox protein ARX, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARXQ96QS3 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ARXQ96QS3 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ARXQ96QS3 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ARXQ96QS3 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ARXQ96QS3 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ARXQ96QS3 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ARXQ96QS3 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ARXQ96QS3 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
ARXQ96QS3 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ARXQ96QS3 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ARXQ96QS3 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ARXQ96QS3 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ARXQ96QS3 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ARXQ96QS3 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ARXQ96QS3 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
ARXQ96QS3 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ARXQ96QS3 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ARXQ96QS3 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ARXQ96QS3 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
ARXQ96QS3 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ARXQ96QS3 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ARXQ96QS3 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ARXQ96QS3 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ARXQ96QS3 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ARXQ96QS3 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ARXQ96QS3 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ARXQ96QS3 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ARXQ96QS3 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ARXQ96QS3 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ARXQ96QS3 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ARXQ96QS3 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
ARXQ96QS3 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
ARXQ96QS3 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
ARXQ96QS3 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ARXQ96QS3 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ARXQ96QS3 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ARXQ96QS3 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ARXQ96QS3 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ARXQ96QS3 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ARXQ96QS3 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ARXQ96QS3 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ARXQ96QS3 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
ARXQ96QS3 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ARXQ96QS3 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ARXQ96QS3 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ARXQ96QS3 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ARXQ96QS3 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ARXQ96QS3 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ARXQ96QS3 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ARXQ96QS3 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ARXQ96QS3 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ARXQ96QS3 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ARXQ96QS3 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ARXQ96QS3 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ARXQ96QS3 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ARXQ96QS3 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ARXQ96QS3 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ARXQ96QS3 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ARXQ96QS3 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ARXQ96QS3 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ARXQ96QS3 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ARXQ96QS3 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ARXQ96QS3 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
ARXQ96QS3 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ARXQ96QS3 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ARXQ96QS3 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
ARXQ96QS3 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ARXQ96QS3 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ARXQ96QS3 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ARXQ96QS3 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ARXQ96QS3 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ARXQ96QS3 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ARXQ96QS3 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ARXQ96QS3 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ARXQ96QS3 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ARXQ96QS3 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ARXQ96QS3 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ARXQ96QS3 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ARXQ96QS3 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ARXQ96QS3 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ARXQ96QS3 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ARXQ96QS3 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ARXQ96QS3 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
ARXQ96QS3 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
ARXQ96QS3 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ARXQ96QS3 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ARXQ96QS3 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
ARXQ96QS3 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ARXQ96QS3 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ARXQ96QS3 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ARXQ96QS3 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ARXQ96QS3 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ARXQ96QS3 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ARXQ96QS3 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ARXQ96QS3 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
ARXQ96QS3 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
ARXQ96QS3 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ARXQ96QS3 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ARXQ96QS3 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ARXQ96QS3 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms