Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF7

GCNA, Acidic repeat-containing protein, humanhuman

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Length 691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNAQ96QF7 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GCNAQ96QF7 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GCNAQ96QF7 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GCNAQ96QF7 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GCNAQ96QF7 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GCNAQ96QF7 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GCNAQ96QF7 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GCNAQ96QF7 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
GCNAQ96QF7 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GCNAQ96QF7 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GCNAQ96QF7 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GCNAQ96QF7 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GCNAQ96QF7 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GCNAQ96QF7 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GCNAQ96QF7 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
GCNAQ96QF7 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
GCNAQ96QF7 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GCNAQ96QF7 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GCNAQ96QF7 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GCNAQ96QF7 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GCNAQ96QF7 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
GCNAQ96QF7 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GCNAQ96QF7 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GCNAQ96QF7 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GCNAQ96QF7 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GCNAQ96QF7 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
GCNAQ96QF7 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GCNAQ96QF7 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GCNAQ96QF7 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GCNAQ96QF7 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GCNAQ96QF7 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
GCNAQ96QF7 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
GCNAQ96QF7 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GCNAQ96QF7 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GCNAQ96QF7 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GCNAQ96QF7 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GCNAQ96QF7 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GCNAQ96QF7 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GCNAQ96QF7 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GCNAQ96QF7 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GCNAQ96QF7 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GCNAQ96QF7 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GCNAQ96QF7 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GCNAQ96QF7 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GCNAQ96QF7 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GCNAQ96QF7 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GCNAQ96QF7 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GCNAQ96QF7 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GCNAQ96QF7 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GCNAQ96QF7 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GCNAQ96QF7 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GCNAQ96QF7 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GCNAQ96QF7 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GCNAQ96QF7 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GCNAQ96QF7 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GCNAQ96QF7 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GCNAQ96QF7 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GCNAQ96QF7 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GCNAQ96QF7 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GCNAQ96QF7 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GCNAQ96QF7 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
GCNAQ96QF7 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GCNAQ96QF7 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GCNAQ96QF7 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GCNAQ96QF7 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GCNAQ96QF7 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GCNAQ96QF7 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GCNAQ96QF7 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GCNAQ96QF7 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GCNAQ96QF7 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GCNAQ96QF7 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GCNAQ96QF7 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GCNAQ96QF7 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GCNAQ96QF7 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GCNAQ96QF7 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GCNAQ96QF7 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
GCNAQ96QF7 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GCNAQ96QF7 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GCNAQ96QF7 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GCNAQ96QF7 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GCNAQ96QF7 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GCNAQ96QF7 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GCNAQ96QF7 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GCNAQ96QF7 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GCNAQ96QF7 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GCNAQ96QF7 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GCNAQ96QF7 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GCNAQ96QF7 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GCNAQ96QF7 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GCNAQ96QF7 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GCNAQ96QF7 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
GCNAQ96QF7 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GCNAQ96QF7 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
GCNAQ96QF7 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GCNAQ96QF7 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GCNAQ96QF7 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GCNAQ96QF7 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GCNAQ96QF7 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GCNAQ96QF7 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GCNAQ96QF7 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
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