Protein–RNA interactions for Protein: Q96N95

ZNF396, Zinc finger protein 396, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF396Q96N95 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZNF396Q96N95 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZNF396Q96N95 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
ZNF396Q96N95 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
ZNF396Q96N95 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZNF396Q96N95 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZNF396Q96N95 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZNF396Q96N95 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZNF396Q96N95 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZNF396Q96N95 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZNF396Q96N95 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZNF396Q96N95 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZNF396Q96N95 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZNF396Q96N95 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZNF396Q96N95 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZNF396Q96N95 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZNF396Q96N95 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZNF396Q96N95 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZNF396Q96N95 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZNF396Q96N95 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZNF396Q96N95 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZNF396Q96N95 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZNF396Q96N95 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZNF396Q96N95 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZNF396Q96N95 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZNF396Q96N95 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZNF396Q96N95 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZNF396Q96N95 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZNF396Q96N95 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNF396Q96N95 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNF396Q96N95 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNF396Q96N95 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNF396Q96N95 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNF396Q96N95 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNF396Q96N95 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNF396Q96N95 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNF396Q96N95 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNF396Q96N95 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNF396Q96N95 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNF396Q96N95 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNF396Q96N95 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNF396Q96N95 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNF396Q96N95 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNF396Q96N95 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNF396Q96N95 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNF396Q96N95 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNF396Q96N95 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNF396Q96N95 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF396Q96N95 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF396Q96N95 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF396Q96N95 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF396Q96N95 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF396Q96N95 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF396Q96N95 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF396Q96N95 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF396Q96N95 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF396Q96N95 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF396Q96N95 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF396Q96N95 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF396Q96N95 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF396Q96N95 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF396Q96N95 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF396Q96N95 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF396Q96N95 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZNF396Q96N95 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZNF396Q96N95 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZNF396Q96N95 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZNF396Q96N95 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZNF396Q96N95 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZNF396Q96N95 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
ZNF396Q96N95 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZNF396Q96N95 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZNF396Q96N95 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZNF396Q96N95 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ZNF396Q96N95 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ZNF396Q96N95 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZNF396Q96N95 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZNF396Q96N95 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZNF396Q96N95 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZNF396Q96N95 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZNF396Q96N95 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZNF396Q96N95 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZNF396Q96N95 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZNF396Q96N95 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZNF396Q96N95 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZNF396Q96N95 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZNF396Q96N95 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF396Q96N95 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF396Q96N95 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF396Q96N95 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF396Q96N95 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF396Q96N95 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF396Q96N95 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF396Q96N95 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF396Q96N95 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF396Q96N95 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF396Q96N95 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF396Q96N95 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF396Q96N95 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF396Q96N95 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10 ms