Protein–RNA interactions for Protein: Q96MN9

ZNF488, Zinc finger protein 488, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF488Q96MN9 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNF488Q96MN9 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNF488Q96MN9 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNF488Q96MN9 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNF488Q96MN9 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNF488Q96MN9 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNF488Q96MN9 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNF488Q96MN9 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNF488Q96MN9 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNF488Q96MN9 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNF488Q96MN9 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNF488Q96MN9 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNF488Q96MN9 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNF488Q96MN9 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNF488Q96MN9 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNF488Q96MN9 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZNF488Q96MN9 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
ZNF488Q96MN9 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZNF488Q96MN9 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZNF488Q96MN9 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZNF488Q96MN9 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZNF488Q96MN9 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZNF488Q96MN9 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZNF488Q96MN9 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZNF488Q96MN9 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
ZNF488Q96MN9 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZNF488Q96MN9 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZNF488Q96MN9 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZNF488Q96MN9 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZNF488Q96MN9 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
ZNF488Q96MN9 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZNF488Q96MN9 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZNF488Q96MN9 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZNF488Q96MN9 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZNF488Q96MN9 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZNF488Q96MN9 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
ZNF488Q96MN9 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZNF488Q96MN9 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZNF488Q96MN9 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZNF488Q96MN9 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZNF488Q96MN9 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZNF488Q96MN9 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZNF488Q96MN9 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZNF488Q96MN9 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZNF488Q96MN9 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZNF488Q96MN9 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZNF488Q96MN9 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZNF488Q96MN9 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZNF488Q96MN9 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
ZNF488Q96MN9 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZNF488Q96MN9 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZNF488Q96MN9 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZNF488Q96MN9 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZNF488Q96MN9 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZNF488Q96MN9 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZNF488Q96MN9 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZNF488Q96MN9 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZNF488Q96MN9 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZNF488Q96MN9 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZNF488Q96MN9 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNF488Q96MN9 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNF488Q96MN9 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNF488Q96MN9 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNF488Q96MN9 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNF488Q96MN9 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNF488Q96MN9 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNF488Q96MN9 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNF488Q96MN9 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNF488Q96MN9 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNF488Q96MN9 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNF488Q96MN9 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNF488Q96MN9 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNF488Q96MN9 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNF488Q96MN9 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNF488Q96MN9 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNF488Q96MN9 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNF488Q96MN9 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNF488Q96MN9 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNF488Q96MN9 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNF488Q96MN9 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNF488Q96MN9 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNF488Q96MN9 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNF488Q96MN9 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNF488Q96MN9 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNF488Q96MN9 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNF488Q96MN9 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNF488Q96MN9 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNF488Q96MN9 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ZNF488Q96MN9 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF488Q96MN9 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF488Q96MN9 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF488Q96MN9 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF488Q96MN9 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF488Q96MN9 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF488Q96MN9 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF488Q96MN9 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF488Q96MN9 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF488Q96MN9 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF488Q96MN9 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF488Q96MN9 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.7 ms