Protein–RNA interactions for Protein: Q96JG6

VPS50, Syndetin, humanhuman

Predictions only

Length 964 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS50Q96JG6 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VPS50Q96JG6 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VPS50Q96JG6 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VPS50Q96JG6 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VPS50Q96JG6 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VPS50Q96JG6 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VPS50Q96JG6 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VPS50Q96JG6 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VPS50Q96JG6 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VPS50Q96JG6 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VPS50Q96JG6 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VPS50Q96JG6 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VPS50Q96JG6 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VPS50Q96JG6 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VPS50Q96JG6 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
VPS50Q96JG6 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VPS50Q96JG6 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
VPS50Q96JG6 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VPS50Q96JG6 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VPS50Q96JG6 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VPS50Q96JG6 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VPS50Q96JG6 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VPS50Q96JG6 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VPS50Q96JG6 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VPS50Q96JG6 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VPS50Q96JG6 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VPS50Q96JG6 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
VPS50Q96JG6 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VPS50Q96JG6 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VPS50Q96JG6 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VPS50Q96JG6 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VPS50Q96JG6 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VPS50Q96JG6 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VPS50Q96JG6 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VPS50Q96JG6 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VPS50Q96JG6 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VPS50Q96JG6 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VPS50Q96JG6 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VPS50Q96JG6 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VPS50Q96JG6 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VPS50Q96JG6 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VPS50Q96JG6 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VPS50Q96JG6 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VPS50Q96JG6 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VPS50Q96JG6 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VPS50Q96JG6 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VPS50Q96JG6 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VPS50Q96JG6 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VPS50Q96JG6 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VPS50Q96JG6 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VPS50Q96JG6 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VPS50Q96JG6 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VPS50Q96JG6 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VPS50Q96JG6 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VPS50Q96JG6 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VPS50Q96JG6 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VPS50Q96JG6 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VPS50Q96JG6 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VPS50Q96JG6 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VPS50Q96JG6 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VPS50Q96JG6 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VPS50Q96JG6 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VPS50Q96JG6 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
VPS50Q96JG6 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VPS50Q96JG6 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
VPS50Q96JG6 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VPS50Q96JG6 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VPS50Q96JG6 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VPS50Q96JG6 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VPS50Q96JG6 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
VPS50Q96JG6 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
VPS50Q96JG6 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
VPS50Q96JG6 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
VPS50Q96JG6 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VPS50Q96JG6 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
VPS50Q96JG6 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VPS50Q96JG6 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VPS50Q96JG6 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VPS50Q96JG6 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VPS50Q96JG6 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
VPS50Q96JG6 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VPS50Q96JG6 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
VPS50Q96JG6 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
VPS50Q96JG6 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
VPS50Q96JG6 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
VPS50Q96JG6 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
VPS50Q96JG6 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
VPS50Q96JG6 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
VPS50Q96JG6 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
VPS50Q96JG6 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
VPS50Q96JG6 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
VPS50Q96JG6 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
VPS50Q96JG6 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
VPS50Q96JG6 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
VPS50Q96JG6 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
VPS50Q96JG6 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
VPS50Q96JG6 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
VPS50Q96JG6 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
VPS50Q96JG6 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
VPS50Q96JG6 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms