Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXI8

CLEC4D, C-type lectin domain family 4 member D, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC4DQ8WXI8 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLEC4DQ8WXI8 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLEC4DQ8WXI8 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLEC4DQ8WXI8 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLEC4DQ8WXI8 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CLEC4DQ8WXI8 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLEC4DQ8WXI8 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLEC4DQ8WXI8 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLEC4DQ8WXI8 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLEC4DQ8WXI8 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLEC4DQ8WXI8 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLEC4DQ8WXI8 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLEC4DQ8WXI8 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLEC4DQ8WXI8 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLEC4DQ8WXI8 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CLEC4DQ8WXI8 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLEC4DQ8WXI8 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLEC4DQ8WXI8 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLEC4DQ8WXI8 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLEC4DQ8WXI8 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLEC4DQ8WXI8 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CLEC4DQ8WXI8 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLEC4DQ8WXI8 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLEC4DQ8WXI8 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLEC4DQ8WXI8 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLEC4DQ8WXI8 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLEC4DQ8WXI8 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLEC4DQ8WXI8 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLEC4DQ8WXI8 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLEC4DQ8WXI8 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLEC4DQ8WXI8 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLEC4DQ8WXI8 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLEC4DQ8WXI8 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLEC4DQ8WXI8 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLEC4DQ8WXI8 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLEC4DQ8WXI8 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLEC4DQ8WXI8 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLEC4DQ8WXI8 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLEC4DQ8WXI8 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLEC4DQ8WXI8 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLEC4DQ8WXI8 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLEC4DQ8WXI8 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLEC4DQ8WXI8 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLEC4DQ8WXI8 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLEC4DQ8WXI8 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLEC4DQ8WXI8 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLEC4DQ8WXI8 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CLEC4DQ8WXI8 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CLEC4DQ8WXI8 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLEC4DQ8WXI8 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLEC4DQ8WXI8 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLEC4DQ8WXI8 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLEC4DQ8WXI8 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLEC4DQ8WXI8 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLEC4DQ8WXI8 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLEC4DQ8WXI8 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CLEC4DQ8WXI8 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLEC4DQ8WXI8 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLEC4DQ8WXI8 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLEC4DQ8WXI8 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLEC4DQ8WXI8 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLEC4DQ8WXI8 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLEC4DQ8WXI8 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLEC4DQ8WXI8 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CLEC4DQ8WXI8 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLEC4DQ8WXI8 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLEC4DQ8WXI8 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLEC4DQ8WXI8 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLEC4DQ8WXI8 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLEC4DQ8WXI8 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLEC4DQ8WXI8 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLEC4DQ8WXI8 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLEC4DQ8WXI8 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLEC4DQ8WXI8 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLEC4DQ8WXI8 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CLEC4DQ8WXI8 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLEC4DQ8WXI8 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLEC4DQ8WXI8 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLEC4DQ8WXI8 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLEC4DQ8WXI8 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLEC4DQ8WXI8 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLEC4DQ8WXI8 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLEC4DQ8WXI8 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CLEC4DQ8WXI8 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLEC4DQ8WXI8 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLEC4DQ8WXI8 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLEC4DQ8WXI8 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLEC4DQ8WXI8 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CLEC4DQ8WXI8 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLEC4DQ8WXI8 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLEC4DQ8WXI8 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLEC4DQ8WXI8 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLEC4DQ8WXI8 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLEC4DQ8WXI8 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CLEC4DQ8WXI8 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLEC4DQ8WXI8 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLEC4DQ8WXI8 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLEC4DQ8WXI8 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLEC4DQ8WXI8 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLEC4DQ8WXI8 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms