Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXA3

RUFY2, RUN and FYVE domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY2Q8WXA3 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RUFY2Q8WXA3 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RUFY2Q8WXA3 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RUFY2Q8WXA3 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RUFY2Q8WXA3 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RUFY2Q8WXA3 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RUFY2Q8WXA3 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RUFY2Q8WXA3 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RUFY2Q8WXA3 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RUFY2Q8WXA3 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RUFY2Q8WXA3 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RUFY2Q8WXA3 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RUFY2Q8WXA3 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RUFY2Q8WXA3 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RUFY2Q8WXA3 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RUFY2Q8WXA3 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RUFY2Q8WXA3 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RUFY2Q8WXA3 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RUFY2Q8WXA3 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RUFY2Q8WXA3 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
RUFY2Q8WXA3 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RUFY2Q8WXA3 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RUFY2Q8WXA3 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RUFY2Q8WXA3 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RUFY2Q8WXA3 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RUFY2Q8WXA3 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RUFY2Q8WXA3 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
RUFY2Q8WXA3 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RUFY2Q8WXA3 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RUFY2Q8WXA3 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RUFY2Q8WXA3 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RUFY2Q8WXA3 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RUFY2Q8WXA3 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RUFY2Q8WXA3 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RUFY2Q8WXA3 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RUFY2Q8WXA3 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RUFY2Q8WXA3 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RUFY2Q8WXA3 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
RUFY2Q8WXA3 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RUFY2Q8WXA3 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RUFY2Q8WXA3 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RUFY2Q8WXA3 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RUFY2Q8WXA3 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RUFY2Q8WXA3 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RUFY2Q8WXA3 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RUFY2Q8WXA3 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RUFY2Q8WXA3 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RUFY2Q8WXA3 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RUFY2Q8WXA3 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RUFY2Q8WXA3 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RUFY2Q8WXA3 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RUFY2Q8WXA3 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RUFY2Q8WXA3 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RUFY2Q8WXA3 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RUFY2Q8WXA3 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RUFY2Q8WXA3 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RUFY2Q8WXA3 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RUFY2Q8WXA3 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RUFY2Q8WXA3 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RUFY2Q8WXA3 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RUFY2Q8WXA3 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RUFY2Q8WXA3 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RUFY2Q8WXA3 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RUFY2Q8WXA3 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RUFY2Q8WXA3 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RUFY2Q8WXA3 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RUFY2Q8WXA3 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RUFY2Q8WXA3 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RUFY2Q8WXA3 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RUFY2Q8WXA3 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RUFY2Q8WXA3 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RUFY2Q8WXA3 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RUFY2Q8WXA3 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RUFY2Q8WXA3 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RUFY2Q8WXA3 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RUFY2Q8WXA3 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RUFY2Q8WXA3 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RUFY2Q8WXA3 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RUFY2Q8WXA3 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RUFY2Q8WXA3 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RUFY2Q8WXA3 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RUFY2Q8WXA3 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RUFY2Q8WXA3 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RUFY2Q8WXA3 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RUFY2Q8WXA3 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RUFY2Q8WXA3 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RUFY2Q8WXA3 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RUFY2Q8WXA3 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RUFY2Q8WXA3 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RUFY2Q8WXA3 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RUFY2Q8WXA3 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RUFY2Q8WXA3 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RUFY2Q8WXA3 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RUFY2Q8WXA3 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RUFY2Q8WXA3 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RUFY2Q8WXA3 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RUFY2Q8WXA3 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
RUFY2Q8WXA3 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
RUFY2Q8WXA3 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
RUFY2Q8WXA3 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms