Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVX3

C4orf3, Uncharacterized protein C4orf3, humanhuman

Predictions only

Length 66 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf3Q8WVX3 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C4orf3Q8WVX3 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C4orf3Q8WVX3 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
C4orf3Q8WVX3 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C4orf3Q8WVX3 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C4orf3Q8WVX3 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C4orf3Q8WVX3 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C4orf3Q8WVX3 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C4orf3Q8WVX3 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C4orf3Q8WVX3 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C4orf3Q8WVX3 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C4orf3Q8WVX3 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C4orf3Q8WVX3 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C4orf3Q8WVX3 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C4orf3Q8WVX3 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C4orf3Q8WVX3 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
C4orf3Q8WVX3 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C4orf3Q8WVX3 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C4orf3Q8WVX3 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C4orf3Q8WVX3 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C4orf3Q8WVX3 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C4orf3Q8WVX3 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C4orf3Q8WVX3 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C4orf3Q8WVX3 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C4orf3Q8WVX3 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C4orf3Q8WVX3 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C4orf3Q8WVX3 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C4orf3Q8WVX3 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C4orf3Q8WVX3 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C4orf3Q8WVX3 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C4orf3Q8WVX3 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C4orf3Q8WVX3 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C4orf3Q8WVX3 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
C4orf3Q8WVX3 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C4orf3Q8WVX3 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C4orf3Q8WVX3 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C4orf3Q8WVX3 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C4orf3Q8WVX3 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
C4orf3Q8WVX3 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C4orf3Q8WVX3 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
C4orf3Q8WVX3 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C4orf3Q8WVX3 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C4orf3Q8WVX3 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C4orf3Q8WVX3 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C4orf3Q8WVX3 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C4orf3Q8WVX3 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C4orf3Q8WVX3 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C4orf3Q8WVX3 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C4orf3Q8WVX3 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C4orf3Q8WVX3 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C4orf3Q8WVX3 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C4orf3Q8WVX3 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C4orf3Q8WVX3 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C4orf3Q8WVX3 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C4orf3Q8WVX3 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C4orf3Q8WVX3 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C4orf3Q8WVX3 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
C4orf3Q8WVX3 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C4orf3Q8WVX3 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
C4orf3Q8WVX3 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
C4orf3Q8WVX3 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C4orf3Q8WVX3 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C4orf3Q8WVX3 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C4orf3Q8WVX3 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C4orf3Q8WVX3 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C4orf3Q8WVX3 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
C4orf3Q8WVX3 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C4orf3Q8WVX3 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
C4orf3Q8WVX3 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C4orf3Q8WVX3 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C4orf3Q8WVX3 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C4orf3Q8WVX3 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C4orf3Q8WVX3 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C4orf3Q8WVX3 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C4orf3Q8WVX3 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C4orf3Q8WVX3 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C4orf3Q8WVX3 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C4orf3Q8WVX3 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C4orf3Q8WVX3 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C4orf3Q8WVX3 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C4orf3Q8WVX3 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C4orf3Q8WVX3 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C4orf3Q8WVX3 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C4orf3Q8WVX3 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C4orf3Q8WVX3 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C4orf3Q8WVX3 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C4orf3Q8WVX3 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C4orf3Q8WVX3 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C4orf3Q8WVX3 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
C4orf3Q8WVX3 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C4orf3Q8WVX3 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C4orf3Q8WVX3 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C4orf3Q8WVX3 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C4orf3Q8WVX3 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C4orf3Q8WVX3 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C4orf3Q8WVX3 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C4orf3Q8WVX3 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C4orf3Q8WVX3 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C4orf3Q8WVX3 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C4orf3Q8WVX3 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms